時は令和。東京歌舞伎町にひっそりとたたずむ、高校がある。「東京都立水商業高等学校」略して「都立水商」。ここは水商売に関する専門教育を行う都立高校だ。 就活中の石綿直樹(竜星涼)は、彼女の大海原春香（堀田茜）のため、「先生」の肩書欲しさで水商へ就職。そして就職後初めてこの高校が水商売専門の高校であることを知り、訳も分からず働き始めることとなる。そして３年C組の担任を受け持つことになった直樹だが、着任早々、生徒たちが起こす思いもよらないトラブルに次々と巻き込まれることになり…！？
新米の社会科教師・直樹（竜星涼）が受け持つことになった３年C組では、生徒の進路指導を行うことに。しかし水商売の右も左も分からず、キャバクラに行ったことすらない直樹は、生徒達に呆れられるばかり。悩んだ直樹は、キャバクラ科教師の千花（松井玲奈）に誘われ授業を見に行くことになる。 そこには、ルックスが最重要というキャバクラ業界の厳しい現実と、自分がブスだと悩む百合（大原優乃）の姿が。なんとか百合の武器はないかと考える直樹だが…！？
水商売のプロフェッショナルを育てる都立水商は、アマチュア気分で夜のバイトをすることを固く禁じていた。 ある日、希海（恒松祐里）に呼び出された直樹（竜星涼）は、哲太（瀬戸利樹）がホストクラブから出てくるところを目撃してしまう。哲太は入院した母の代わりに、小さな弟と妹達を食べさせるため、ホストのバイトで生活費を稼ごうとしていたのだった。しかし新人ホストの道はやはり甘くはなく、喋りが苦手な哲太は全く稼げていないらしい。 悩んだ直樹は、哲太のバイトを見逃しながら、新人ホストが成功する秘訣を探そうとするが…！？
都立水商３年に、「接客実習ウィーク」が近づいていた。接客実習ウィークとは、放課後３時間だけ実習室で模擬キャバクラを開店する６日間のこと。この実習でナンバーワンになれば就職に有利、と既にキャバクラ科の生徒達は校内中の男子達に愛想を振りまき始めていた。そして、学園内で圧倒的人気を誇るマドンナ・聖菜（伊藤萌々香）は希海（恒松祐里）に接客実習ウィークでの売り上げを競う、ある大勝負を持ちかける――。 そんな中、マネージャー科でも接客実習ウィークに向け、「つけ回し」の授業が行われていた。クラスイチのお調子者・周（神尾楓珠）が、つけ回しに挑んでみるが…！？
放課後に実習室で模擬キャバクラを開店する都立水商の恒例行事、「接客実習ウィーク」の後半。聖菜（伊藤萌々香）と売上を競っている希海（恒松祐里）は、ようやく売上を伸ばし始めるが、前半を終えての売上順位は、依然聖菜がダントツの首位だった。勝負に負けるとキャバクラ科をやめなくてはいけない希海は直樹（竜星涼）の助言もあり、まだ模擬キャバクラに足を運んでいないであろうアニメ研究会の部員たちを取り込もうと、ある“秘策”を試みる。 そんな中、聖菜の客が、聖菜を思うあまり、客と店員の関係を超えて聖菜に近付こうとし――。
都立水商に、就活の時期がやってきた。既に有名店からのオファーを受ける生徒もおり、校内にも緊迫したムードが漂う中、直樹（竜星涼）も３年C組の生徒達が無事就職できるよう奔走する。そんな中、聖菜(伊藤萌々香)は哲太（瀬戸利樹）を揺さぶり不穏な行動を始めていた――。 一方、春香(堀田茜)が直樹の職場を見学したいと、こっそり学校を訪ねてきてしまう。水産系の高校に就職したと春香に嘘をついてきた直樹だが、校内に響き渡るシャンパンコール、グラスの乗ったトレイを持って廊下を歩くマネージャー科生徒など、どう見ても水産系の高校には見えない水商校内！直樹、絶体絶命の大ピンチ！？
大竹哲太(瀬戸利樹)が警察に補導されたとの連絡が…！玉造校長（升毅）やホスト科教師小木曽義和（濱津隆之）も事実確認に追われていた。酔っぱらいに絡まれて喧嘩になっただけという哲太だが、殴りかかる動画がネット上で出回り、水商全体を揺るがす大きな事件となっていた。何かがひっかかる直樹（竜星涼）は事件の真相を探ろうと模索する。 一方、希海（恒松祐里）も哲太の喧嘩の原因に聖菜（伊藤萌々香）が絡んでいるのではと推測し、探りを入れ始めていた。やがて周（神尾楓珠）やアニ研メンバーの協力を経てたどり着いたのは、彼らが予想だにしなかった、ある恐ろしい事実だった――。
時は令和。東京歌舞伎町にひっそりとたたずむ、高校がある。「東京都立水商業高等学校」略して「都立水商」。ここは水商売に関する専門教育を行う都立高校だ。直樹（竜星涼）が３年C組の担任になってから多くの月日が流れ、そして今彼の手には辞表が握られていた。教師としての自覚が芽生え始めていた矢先の大きな事件に対し、３年C組の生徒達、何より事件黒幕の聖菜（伊藤萌々香）にどう言葉をかければいいか途方にくれていたのである。 やがて希海（恒松祐里）との会話から力を得た直樹は、担任として“最後の授業”を始めることになり…！？直樹が出した答えとは、そして生徒たちが掴む未来は――。 「都立水商！～令和～」波乱の最終回、開幕。