Maya and Kyouhei go on a mission to rescue Kazuki at Moldova base. At the same time, the Neo UN fleet invades the Alvis base, trying to secure the island by taking control of the red female core, revealed to be a Coagula Type Festum, however it has left its container. Meanwhile, Yoji manages to persuade Mjolnir, the Master Type Festum which has assimilated Akane Makabe, to give the Fafner Mark Sein to Kazuki. Yukie, as well as Col. Dudley Barns, questions Fumihiko and Soushi concerning the whereabouts of the female core, but the latter two are unaware of its current location. While Kyouhei fends off the Festum in the laboratory, Yoji gives Maya the research data of the Fafner Mark Sein.
真矢は溝口とともに人類軍モルドヴァ基地へ向かった。その直後、竜宮島に人類軍占領部隊が到着。人間相手に戦えない史彦は戦いを放棄し、島民の避難を優先させる。続々と上陸する人類軍占領部隊。晴れて人類軍の軍服に身を包んだ由紀恵はワルキューレの岩戸へ急行するが、そこにコアはいなくなっていて…。
Maya y Kyouhei emprenden una misión para rescatar a Kazuki en la base de Moldavia. Al mismo tiempo, la flota de Neo UN invade la base de Alvis, tratando de asegurar la isla tomando el control del núcleo femenino rojo, revelado como un Coagula Type Festum, sin embargo, ha dejado su contenedor. Mientras tanto, Yoji logra persuadir a Mjolnir, el Master Type Festum que ha asimilado a Akane Makabe, para que le dé el Fafner Mark Sein a Kazuki. Yukie, así como el coronel Dudley Barns, interrogan a Fumihiko y Soushi sobre el paradero del núcleo femenino, pero los dos últimos desconocen su ubicación actual. Mientras Kyouhei se defiende del Festum en el laboratorio, Yoji le da a Maya los datos de investigación del Fafner Mark Sein.