The special is set 3 years prior to the drama series, with the story being related to a murder case that was partly referenced in the original show. Detective Kusanagi is looking to solve a murder mystery, and he gets back in touch with his former badminton teammate, the brilliant professor Yukawa Manabu. --Tokyograph
海辺近くの友永家で、離れが突如炎上。焼け跡からそこに住んでいた息子・邦宏の遺体が見つかる。当初は焼死と見られたが、刀のような刃物で刺されていたことが判明する。しかし離れには何者かが侵入した痕跡はなく、捜査に当たった草薙は専門家に意見を聴くため、母校の帝都大学を訪れる。
その帰り際、大学の掲示板に学生時代の友人と同じ名前の助教授（湯川学）の名を見かけた草薙は、湯川の研究室に足を運ぶ。草薙は学生時代に殺人容疑を掛けられ、窮地を湯川に救われた経験があり、再会した湯川に捜査協力を依頼する。草薙から聞かされた事件に全く興味を示さない湯川だったが、「現場近くのビーチには水着姿の女性がいる」と草薙から唆され、助手の栗林を連れて現場に向かうことになる。
바닷가 근처의 토모나가가(家)의 별채가 갑자기 불타오른다. 그리고 불이 난 그곳에서 살고 있던 아들 쿠니히로가 시체로 발견된다. 초기에는 화재로 인한 사망으로 보였지만 이후 검에 찔려 죽은것으로 판명된다. 하지만 별채에는 아무도 침입한 흔적이 없어 수사를 맡은 쿠사나기는 전문가에게 의견을 묻기 위해 자신의 모교 테이토 대학을 찾아간다.
돌아가던 중, 대학 게시판에서 학창시절 동기와 같은 이름인 조교수(유카와 마나부)의 이름을 발견하고서 쿠사나기는 유카와의 연구실로 발길을 옮긴다. 쿠사나기는 대학시절에 살인용의자로 지목되어 궁지에 몰렸을 때 유카와의 도움으로 풀려난 경험이 있어, 다시 만난 유카와에게 수사협력을 의뢰한다. 쿠사나기로부터 들은 사건에 전혀 흥미를 보이지 않던 유카와였지만 '현장 근처 해변가에는 수영복 차림의 여성들이 있다'라는 쿠사나기의 꼬임에 조수인 쿠리바야시를 데리고 현장으로 향하게 된다.
在內海薰委任湯川學查案的三年前....。
某小島發生了密室殺人事件。男人被用像日本刀一樣的刀具從後方被刺殺，事件現場的小房間爆炸起火。在場目擊証人們的証言，並沒看到犯人影像。房間由內鎖上了鏈子，亦無外人出入的痕跡。
為了解決密室殺人事件，草薙刑警探訪母校帝都大學，發現公佈上有著懷念的名字：湯川學。以前是草薙羽毛球隊的同級生，現在成了帝都大學理工學院物理學專科的副教授。湯川在學生時代就被稱為是天才，草薙抱著一線希望，決定請湯川協助調查。
在萬年助手栗林的阻止下，草薙用「現場附近海灘有成群比基尼美女」為由，成功騙了湯川。湯川的學生：鹽野谷對案件很有興趣，於是私下跟了去....
另，依靠輪椅生活受害者父親友永幸正、受害者妹妹為了父親的看護放棄自己人生的奈美惠，加上她的未婚夫紺野宗介....到底犯人是誰？動機為何？又是如何製造出密室殺人的手法？
這是天才教授湯川學，與舊友草薙刑警一起，第一次致力於搜查的事件。
