6,500万年前の地球、リュウソウ族とドルイドン族が激しい戦いを繰り広げるなか、隕石が迫る。ドルイドンはリュウソウ族の地球脱出用の宇宙船をすべて破壊し宇宙へ逃亡する。
2019年現在の地球ではコウたち6人とういと尚久が福井県立恐竜博物館にやってきていた。するとそこに6,500万年前の古代のリュウソウ族であるユノがタイムスリップしてきた。そこに現れた始祖マイナソーの能力によって6,500万年前にタイムスリップすることになる。
タイムスリップした6,500万年前では古代のリュウソウ族の長でユノの父でもあるヴァルマが隕石から逃れるためのシェルターを建設していたものの、選民思想に囚われて決闘に勝ったリュウソウ族のみを収容しヴァルマがその頂点に立つことで世界を支配しようとしていた。
コウたち5人はヴァルマの野望を阻止し、隕石落下を阻止するために過去と現在を行き来することになる[7]。
The Ryusoulgers are sent 65,000,000 years into prehistoric Earth, during the time of the dinosaurs! After encountering members of the very first Ryusoul Tribe, they start to uncover the secrets behind the origins of their people and their Kishiryu partners. However, when Gaisoulg and their ancestors seek to take over the world, what will become of the Ryusoulger's mission to save the future by fighting in the past?!
