Yahiko visits Mount Hiei, and Sanosuke shows him where that battle with Shishio took place. Meanwhile, Kenshin visits an unknown woman's grave, and places flowers by it. Also at this time, Megumi explains to Kaoru the severity of Kenshin's wounds, and that it is important to keep him from doing anything that dangerous again. Finally, the gang gets on the train to Tokyo, with Misao waving to them and telling them to visit again. After the train departs Saito is seen saying that he and Kenshin will meet again one day and settle the score that they have. When the gang reaches the road to the dojo, Kaoru extends her hand and welcomes Kenshin home. Kenshin smiles and says, "It's good to be home."
Após longas reflexões, os heróis se despedem dos amigos de Aoiya e embarcam em um trem rumo a Tokyo. Sem que eles saibam, Saito conseguiu escapar da destruição do esconderijo e ainda está vivo.
Kaoru siente que todos han permanecido en Kioto lo suficiente, además de todos los sucesos que ha marcado la vida de Kenshin en su lucha contra Shishio, por lo que deciden regresar a Tokio. Antes de ello, cada uno toma rumbos diferentes como una despedida. Kenshin va al cementerio a dejar flores a la tumba de una mujer de su pasado y al mismo tiempo se despide de Seijuro.
시시오와의 싸움을 끝내고 건강을 되찾은 켄신 일행은 도쿄로 돌아가기로 한다. 켄신은 교토를 떠나기 전 어떤 무덤에 성묘를 하고 카린과 미사오는 아쉬운 이별의 정을 나누는데…
