Auf der Fähre nach Zweiblattdorf, Lucias Zuhause, sind unsere Freunde damit beschäftigt, Pläne für Ihre Zukunft zu machen. Lucia lädt Ash und Rocko ein, noch bei Ihr zu bleiben, bevor sich ihre Wege dann endgültig trennen werden. Außerdem lernen unsere Freunde auf der Fähre Verena kennen. Sie ist in der Ausbildung zu einer Vorschullehrerin für Pokémon und muss auf eine Gruppe kleiner, süßer Pokémon aufpassen. Doch dann taucht Team Rocket auf, verfolgt von einer Gruppe sehr verärgerter Tentoxa, die für Chaos auf dem Schiff sorgen!
With the Sinnoh League behind them, Ash and friends take a ship back to Dawn's hometown of Twinleaf. A crisis emerges, however, when a group of Tentacruel attack the ship and poison many of the Pokémon on board. With no other doctor on the ship, Brock is the only one who can help those Pokémon. Will he succeed before it's too late?
Luego de la Liga Sinnoh, los chicos se dirigían a Pueblo Hojas Gemelas en barco preparados para despedirse pero después del ataque de unos Tentacruel, un pequeño Pichu se enferma gravemente y Brock es el único que puede salvarlo.
シンオウリーグを終えたサトシ、ヒカリ、タケシの３人は、ヒカリの故郷フタバタウンに向かう船に乗っていた。長かった旅も少しずつ終わりに近付いている・・・。そんな寂しさを噛みしめていると、そこに１匹のピチューが。思わず顔がほころぶ３人。それもそのはず、その後ろから次々とピィにププリン、ルリリにヒメグマなどの可愛いポケモンがやってきたのだ！甲板は途端に和やかなムードに包まれる。しかし、その船の下、海底では恐ろしいことの前兆が起きていた。平和に暮らしていたドククラゲをロケット団が刺激したせいで、怒ったドククラゲたちが海面に向かってきていたのだ！そんなことには気づくはずないポケモンたち。そして、事件は起こった・・・！
