デビモンによって現実世界の東京・渋谷に飛ばされた空、光子郎、ミミ、丈。砂漠に残った太一とヤマトは巨大なバルブモンに遭遇する。バルブモンは何かを輸送中で輸送部隊の指揮を取るのはミノタルモン。彼は大量のトループモンを出撃させ、太一たちを襲わせる。そこにレオモン、コロナモン、スパーダモンが現れて太一たちを救い、太一たちを連れて砂漠を脱出する。デビモンに立ち向かうレジスタンスのリーダー、レオモンはバルブモンが輸送している積荷を奪おうとしていたのだと言う。それは聖なるデジモンに関するあるモノらしいが…。
Thanks to Omegamon’s reappearance, the Mega Digimon Nidhoggmon, was finally defeated. However, Sora and the others disappeared after being swallowed by a storm. Taichi and Yamato, who are left behind in the Digital World sneak into Valvemon.
Graças ao reaparecimento de Omegamon, o Mega Digimon Nidhoggmon foi finalmente derrotado. No entanto, Sora e os outros desapareceram após serem engolidos por uma tempestade. Taichi e Yamato, que são deixados para trás no Mundo Digital, vão sorrateiramente até Valvemon.
Захваљујући Омегамоновом поновном појављивању, Мега Дигимон Нидхогмон је коначно поражен. Међутим, Сора и остали су нестали након што их је прогутала олуја. Таичи и Јамато, који су заостали у Дигиталном свету, инфилтрирају Валвемона.
À peine sortis victorieux du combat contre le terrible Digimon méga Nidhöggmon, une tempête a de nouveau séparé les enfants. Taichi et Yamato continuent leur voyage, et rejoignent Leomon qui livre bataille contre les serviteurs de Devimon.
Los Niños Elegidos se separan y solo Yamato y Taichi se quedan en el Mundo Digital, regresando el resto a Tokio. Los dos niños se encontrarán con Leomon y la resistencia que se enfrenta a Devimon, quien les explicará algunas cosas.
Taichi gelingt es, wieder mit Koshiro in Kontakt zu treten. Doch wo befinden sich er und die anderen? Für Taichi und Yamato steht jedoch eines fest: sie müssen das Heilige Digimon unter allen Umständen finden.
소라, 미나, 한솔, 정석은 인간 세계로 돌아가고 디지털 월드에 남은 태일, 매튜, 아구몬, 파피몬은 계속 성스러운 디지몬을 찾기로 한다. 그러던 중 밸브몬으로 이동 중인 미노타몬 일당의 공격을 받지만 레오몬의 도움으로 무사히 위기를 넘긴다. 미노타몬이 성스러운 디지몬에 관한 걸 데블몬에게 전달하려고 한다는 걸 알게 된 태일과 매튜는 레오몬과 함께 밸브몬에 잠입하고 차례로 황소몬과 미노타몬을 쓰러뜨린다. 미노타몬이 옮기던 게 매튜의 동생 리키란 게 밝혀지고 매튜는 충격에 빠진다.
