Bei Spencer und seinen Freunden regnet es schon seit Tagen! Dazu stürmt es, und jedes neue Gewitter versetzt die Dorfbewohner in Angst und Schrecken. Kasi ist inzwischen zum Chef des technischen Hilfsdienstes ernannt worden und kümmert sich um den voll gelaufenen Schloßkeller von Nepomuk. Als das Wasser auf den Wegen immer höher steigt, beschließt Spencer, seine Freunde wie einst Noah auf das Hausboot zu bringen, das von nun an Arche Moli heißt. Jeder darf allerdings nur sehr wenig Gepäck mitnehmen. Und wie soll man sich auf der Arche gegen den gefährlichen Jungdrachen wehren?