3年前に突如失踪した幼馴染·ユキ(大原優乃)。 平凡な高校生活を送る玲矢(佐藤海音)が深夜の路上で偶然ユキと再会したことから玲矢の人生が大きく動き出す。 玲矢は謎の集団に暴行されているユキを見つけ、必死に庇おうとするが、その集団のリーダー黒瀬(大東立樹)は玲矢に冷たく言い放つ。「その女は夜行だ」。 ユキを助けようとする中で自らも人の血を啜る化け物、夜行(やこう)となってしまった玲矢。戸惑い、絶望している玲矢が出会ったのは夜行の少年·慎一郎(西田至)、そして夜行の少年のバンド404 not foundのメンバーたちだった。 夜行となってしまった少年たちの音楽を通した葛藤・友情の物語が幕を開け、また、人と人ならざる存在“夜行”の壮絶な戦いが始まる。