右京（水谷豊）とチェスで互角に勝負できるＩＱ150の天才少年・山田（中川 翼）が、連続爆破事件の犯人“INVISIBLE（＝透明人間）”を名乗って所轄署に出頭してきた。抵抗する素振りを見せず、そのまま逮捕された山田だったが、右京以外とは一切話すつもりはないと主張し、取り調べ官に指名。しかし、右京の追及に対しても挑発的な態度で応じるだけで、本当の目的を明かそうとしなかった。いっぽう、薫（寺脇康文）は、第二の爆弾テロの被害者が、所轄署の元刑事だと判明したことを受け、何か隠している様子の副署長を追及するが、かわされてしまう。同じ頃、第一の爆弾テロの標的となった市長の山田征志郎（升 毅）は、一連の事態を受け、危機感を募らせていた。そんな中、山田と共謀していると思われる本城（吉田日向）が、再び不穏な動きを見せる。