Sydney sitzt "The Man" gegenüber, ihrer Mutter. Wie wird sie mit dieser Situation umgehen? Auf welcher Seite steht Laura Bristow alias Irina Derevko? Lebt Micheal Vaughn noch? Und was ist mit Will los...
Sydney finds herself face-to-face with her mother, whose intentions for her daughter are made chillingly clear. Meanwhile Sydney continues her search for Vaughn, not knowing if he is dead or alive after being swept away by a wall of water in Taipei. Will's life is forever changed when he learns the truth about SD-6 and Sydney's life as a double agent. Dixon must decide whether or not to inform Sloane of Sydney's suspicious activities.
Sydney récapitule sa mission la plus récente à un psychiatre de la CIA : attachée à une chaise quelque part dans Taipei, Khasinau lui présente son supérieur : Irina Derevko. Celle-ci n'est autre que la mère de Sydney qu'elle croyait morte ...
Sydney fogságba esik. Kiderül, hogy az Emberként emlegetett titokzatos ellenség nem más, mint a saját anyja, a volt KGB-ügynök, Irina Derevko, akit Sydney 20 éven át halottnak hitt. Irina nem bánik kesztyűs kézzel a lányával. Sydneynek végül sikerül kiszabadulnia, Irina pedig váratlanul feladja magát a CIA-nál.
Laura spara contro la figlia. Dixon rivela a Sloane di essere certo del fatto che Syd sta facendo il doppiogioco. Quest'ultima deve scoprire se Vaughn è ancora vivo. Dopo la morte della moglie, Sloane entra a far parte dell'alleanza. Will ritratta quanto scritto sulla SD-6. Laura / Irina si arrende alla CIA.
Sydney fica cara-a-cara com sua mãe, e o reencontro das duas não é nada amigável. Enquanto isso, Sydney continua sua busca por Vaughn, sem saber se ele está vivo ou morto, após ficar preso num galpão que foi inundado com a explosão de uma gigante bola d'água, em Taipei. A vida de Will muda para sempre quando ele descobre a verdade sobre a SD-6 e sobre a vida de Sydney como agente dupla. Dixon tenta decidir se informa a Sloane sobre suas supeitas de Sydney. O destino de Emily, a mulher de Sloane, é revelado e Francie fica próxima do seu sonho de abrir seu próprio restaurante.
Sydney atada a una silla tiene enfrente a Alexander Khasinau (Derrick O'Connor) que la trae la comida, aunque ella no quiere comer, ella quiere preguntarle cosas pero él piensa que debería hacérselas a su jefe porque él no es “el hombre”. “El hombre” es Irina Derevko (Lena Olin), su madre, a la que Syney daba por muerta hace ya 20 años y a la que conocía por Laura Bristow. Pero sin recuperarse de ver a su madre esta le dispara en un brazo intentando sacarle información sobre quien la había enviado.
Syd habla de ello con la psicóloga y le narra como pudo escapar de aquel infierno aunque no entiende que hace allí contando aquello mientras Vaughn está desaparecido. Tras ser herida por su madre se deshizo de una silla de aluminio no reforzado a la que estaba atada gracias a golpearla contra una llave de paso de agua; luego escapó de su encierro y pudo contactar con su padre quien pudo extraerla de Taipei.
Will Tippin está con su padre y sigue sin comprender lo que le pasa y quien es la gente que creía conocer. Además ha de enfrentarse al hecho de que Arvin Sloane (Ron Rifkin) quiere matarle al hacerse público el artículo de Will que narraba el asesinato del prometido de Syd y los entresijos del SD-6. Francie (Merrin Dungey) la llama toda preocupada por Will y Syd intenta quitarle importancia ya que Will está a su aldo, aunque esto no se lo pueda contar, sin embargo su padre Jack se pone manos a la obra y convence a Sloane de que le permita arreglar el problema de Will ya que matarlo sólo daría una publicidad que no les interesa.
Sydney navštěvuje psychiatričku CIA. I na ni byly události posledních dní trochu moc. A Will si musí zničit kariéru, aby si zachoval život.
Sydney weet niet of Vaughn levend uit het water is gekomen, maar ze krijgt het nog moeilijker als haar dood gewaande moeder weer op het toneel verschijnt. Ze is de leider van een schurkenorganisatie die onderdelen van een mysterieus Rambaldi-apparaat verzamelt en heeft een plan dat het leven van haar dochter in gevaar brengt. Wills hele leven verandert als hij achter SD-6 en Sydney's dubbelleven komt. Dixon twijfelt of hij Sloane moet vertellen over het verdachte gedrag van Sydney.
