Sydney erkennt, dass ihre Mutter sie hintergangen hat. Schwer enttäuscht macht sie nun eine Hetzjagd auf Sloane, Irina und Sark. Als die CIA die drei endlich gefunden hat, stirbt eine unschuldige Person...
Sydney faces off with her mother, while Emily must decide whether to side with her husband or betray him.
Tandis que Vaughn est mis hors jeu en raison de l'enquête dont il fait l'objet, Sydney apprend que sa mère a trahi la CIA en volant le manuscrit de Rambaldi et rejoignant Sloane. Irian et Sloane doivent être retrouvé et Jack est officiellement nommé pour diriger la mission ...
Irina tudta nélkül Jack egy alvó adóvevőt ültetett a bőre alá, hogy ha az asszony mégis megszökne a CIA-tól, követni tudják. Sloane egy génkutató központ kutatási eredményeit akarja megszerezni, hogy Rambaldi műveinek segítségével megtalálja az örök élet titkát. Irina vállában az adóvevő sugározni kezd. Sark rájön, és figyelmezteti. Elektrosokkal sikerül hatástalanítaniuk, és a nő ismét eltűnik a CIA látóköréből. Emily találkozik a régen halottnak hitt Irinával, és rájön, hogy férje képtelen megváltozni, ezért jelentkezik a firenzei konzulátuson, és felajánlja, hogy a CIA kezére játssza a férfit. Az akció rosszul sül el, és Dixon pisztolya véletlenül Emilyt találja el...
Jack informa Sydney del tradimento di Irina. Sloane in Toscana si ricongiunge con la moglie Emily. Jack riceve ordini da Kendall di ritrovare Irina, la quale è a Stuttgart insieme a Sark. Will ha scoperto cosa contengono i dati che ha esaminato: si tratta del DNA di milioni di cittadini. Syd è sulle tracce della madre Irina.
Sydney recebe a ajuda inesperada de Emily para capturar Sloane — mas antes Emily terá que decidir se ela irá ficar ao lado do seu marido ou vai traí-lo para ajudar a CIA a prendê-lo. Enquanto isso, Syd tenta impedir que Sloane, Sark e Irina consigam roubar uma tecnologia de código genético de uma empresa alemã — e Syd finalmente enfrenta sua mãe. E Vaughn tenta lidar com as descobertas de sua pesquisa sobre Irina, enquanto recebe um estranho presente de Francie.
Sydney es informada sobre la fuga de su madre. La CIA ha decidido ascender a Jack de forma que pasa a ocupar el cargo del subdirector Kendall. Jack Bristow es el agente mejor capacitado para capturar a su esposa Irina Derevko. Aunque Jack accedió a quitarle a Irina el localizador aprovechó su momento romántico para implantarle un localizador pasivo. Jack localiza a Irina en la Toscana italiana. El servicio de contraespionaje de la Agencia desconfía del agente Michael Vaughn: se ha estado reuniendo sin autorización con agentes del KGB.
Irina se Sloanem chtějí získat výsledky výzkumu lidského genomu. Mohli by si vyrobit geneticky cílený virus. Události však přinutí Sloana, aby se všeho vzdal. A Sydney dostane zprávu vysílanou Irininými náušnicemi, že pravda chce svůj čas
Na haar moeders bedrog bereidt Sydney zich lichamelijk en geestelijk voor op hun volgende ontmoeting. Sydney en Vaughn sporen Irina op in een lab in Duitsland waar zij probeert een gecodeerde database in handen te krijgen. Emily Sloane duikt op in Florence, waar ze moet besluiten of ze samenwerkt met haar man of hem zal verraden.
