Die Agenten erfahren, dass Rambaldis Kästchen nur mit einem Schlüssel geöffnet werden kann, zu dessen Versteck eine Karte aus einzelnen Kristallstücken führt. Bevor sie den Schlüssel bergen können, kommt ihnen der Waffenhändler Bomani in die Quere. Jack verdächtigt Lauren, als Maulwurf tätig zu sein. Um nicht aufzufliegen, soll der Verdacht auf ihren Vater, Senator Reed, gelenkt werden. Als man Sloane in Verbindung zum Senator bringt, wird er verhaftet. Ihm droht die Hinrichtung!
Sydney and Vaughn must track Kazari Bomani down to get hold of a piece of the Rambaldi puzzle. Meanwhile, Jack reveals his suspicions to Senator Reed about his daughter Lauren's allegiances, and Vaughn decides what to do about his marriage.
Le Covenant s'est emparé de l'artefact 45 sur lequel est inscrit 'Irina', mais il ne pourra pas l'ouvrir sans la clé. La CIA est d'ailleurs sur la piste d'une carte qui mènera à cette clé. Sydney apprend que la mystérieuse boîte de Rambaldi pourrait renfermer la trace d'une arme biologique capable de tuer des millions de gens ... Lauren est inquiète : pendant que Jack Bristow manifeste des soupçons quant à sa loyauté, Vaughn lui annonce que leur mariage est un échec ...
Dixon csapata valamint a társaság egy kristályba vésett térképet keres. Aki megtalálja, az tudja majd kinyitni a Rambaldi dobozt. Vaughn elmondja Laurennek, hogy el szeretne válni tőle. Lauren érzi, hogy ebből baj lesz. Jack rájön, hogy Lauren lehet a társaság embere. A bizonyítékokat átadja Reed szenátornak. Sark azt javasolja Laurennek, hogy ölje meg a saját apját, így talán Vaughn vele marad még egy ideig. Ráadásul így a halott apjára terelhetné a kémkedés gyanúját.
Sydney e Vaughn devono impedire che Bomani s'impossessi delle chiavi della scatola di Rambaldi. Jack rivela al senatore Reed i suoi sospetti su Lauren. Sark ordina che quest'ultima uccida suo padre, ma a compiere l'omicidio ci pensa la madre di Lauren. Vaughn prende una decisione definitiva sul suo matrimonio con Lauren.
Sydney e Vaughn precisam seguir Kazari Bomani para capturar uma peça do quebra-cabeça Rambaldi.
Enquanto isso, Jack revela suas suspeitas sobre a lealdade de sua filha ao senador Reed, e Vaughn decide o que fazer com seu casamento.
Vaughn y Sydney están en México. Allí un contacto tiene información sobre un mapa que conduce a un objeto del rompecabezas de Rambaldi. Con la ayuda de un satélite localizan el objeto y envían a Sydney y a Vaughn a recuperarlo. Sloane (Ron Rifkin) esperando su ejecución, para tratar de salvar su vida, facilita a la CIA la información que les permite llegar hasta el mapa. A Vaughn le asaltan dudas respecto a su matrimonio con Lauren por la llegada de Sydney. Sark organiza un plan en el que Lauren debe matar a su padre para que Vaughn vuelva con ella por lástima. Finalmente, Lauren no es capaz de pulsar el gatillo, aunque una inesperada aliada le hace el trabajo sucio.
Rambaldiho skříňka obsahuje biologickou zbraň, ale je k ní zapotřebí klíč. A CIA se podaří zjistit, kde je ukrytý.
Sydney en Vaughn zitten achter de Convenant-leider Kazari Bomani aan om een belangrijk puzzelstukje van het Rambaldi-raadsel te vinden. Ondertussen onthult Jack zijn twijfels aan senator Reed over de loyaliteit van zijn dochter Lauren, krijgt Laurens moeder met een tragedie te maken en neemt Vaughn een besluit over zijn huwelijk.
