Die Alphas verfolgen Isaac, ein Mitglied der Red Flag, der mehrere Initiatoren des Alpha-Programms ermordet hat. Isaak ist allerdings selbst auf der Jagd. Sein Ziel: Danielle, Dr. Rosens Tochter. In letzter Sekunde gelingt es Hicks Isaac zu töten, bevor das Mädchen ihm zum Opfer fällt. Zurück im Hauptquartier der Alphas gesteht Dani, dass sie die Kette eines Red Flags gestohlen hat. War das Schmuckstück der einzige Grund, warum Isaac es auf sie abgesehen hatte?
Rosen and his team find out about a secret red flag meeting. Things come to ahead for the team and the future is cloudy.
L'équipe des Alphas est à la poursuite d'Isaac, le membre du Red Flag qui a tué des collaborateurs du programme. Isaac, quant à lui, pourchasse la fille du docteur Rosen, Dani. Plus tard, l'équipe de Lee Rosen doit choisir son camp après que le ministère de la Défense a été attaqué par le groupe terroriste.
Rosen e il suo team devono scegliere da che parte stare ora che Red Flag lancia il suo attacco finale al Dipartimento della Difesa.
Rosen e sua equipe deve escolher um dos lados quando a bandeira vermelha lança um ataque contra o Departamento de Defesa.
В попытках выследить таинственного убийцу работников альфа-программы, Ли узнает, что злоумышленник на сей раз преследует его дочь, Даниэль. Ожерелье, которое та украла у незнакомца, оказалось ценнее, чем она думала, что подвергло опасности жизнь не только девушки, но и ее окружения. Между тем Гари через Анну узнает о Стэнтоне Пэрише — самом старом и могущественном человеке со способностями, чей манифест и стал доктриной движения «Красный флаг». Раскрыв местоположение встречи Пэриша с членами движения, ФБР устраивает засаду, однако развивающиеся события ставят под сомнение правильность совершенного нападения на экстремистов и сокрытия информации о людях-альфа.
