En 1969, l’élection de Richard Nixon à la tête des États-Unis permet au chef du FBI, J. Edgar Hoover, de poursuivre sa répression du mouvement, à ses yeux la "plus grande menace interne pour la nation". À New York, 21 Black Panthers sont inculpés d’activités terroristes. Face à la multiplication des procès, l’organisation tente de réunir des fonds avec le soutien de personnalités comme Angela Davis ou Jane Fonda. Mais les différentes procédures ternissent l’image du parti, réputé désormais pour être infiltré de toutes parts. Après sa sortie de prison le 5 août 1970, Huey P. Newton souhaite poursuivre les programmes sociaux quand Eldridge Cleaver prône la révolution et l'affrontement avec le gouvernement américain. Les luttes intestines profitent au FBI et ont peu à peu raison de l’organisation. En 1973, l’échec de Bobby Seale à la candidature de la mairie d’Oakland douche tout espoir de normalisation du parti.
