USSDに依頼された内容は、誘拐犯フレデリックと誘拐された少女、シンシアの保護だった。プリスの活躍によってシンシアの救出に成功するものの、誘拐犯はフュージョン（物質融合）機能を極限まで進化させたブーマだった。窮地に陥ったプリスを他のメンバーたちが救い、依頼は成功したかのように思えたが……。
謎の爆発事故が発生したゲノムビルで、プリスとリンナはメイスンに詰めよっていたリンナの友人のアイリンと出会った。その爆発事故で自分の婚約者を失ったアイリンは、婚約者とゲノムの関係を調べ、マスコミに暴露すると言う。だが、そんな彼女にメイスンの手下である女ブーマの鋭い爪が襲いかかった……！
ショウという少年と仲良くなったプリスは誕生パーティに招待され、楽しい一時を過ごしていた。そんな中で、ゲノム社により強制的に立ち退きされようとしていたショウの住むアパートは、メイスンの指示により巨大工作機械で破壊されてしまう。そして、その瓦礫の下敷きになったショウの母親。怒りに燃えるプリスは……。
アウトライダーたちを蹴散らして消える悪魔の怪物マシン“グリフォン”。プリスもグリフォンに襲われ怪我を負ってしまった。病院に向かったプリスは、そこでライダーたちに襲われて入院していたナオミと出会う。そして、なじみのレーヴィン博士の依頼により、グリフォンを止めるべく出動するナイトセイバーズだが……。
宇宙ステーション“ジェナロス”から脱出したセクサロイドのシルヴィとアンリは、プリスと出会った。そして、自由を味わい、束の間の平和に酔うシルヴィだが、アンリの血液を補充するため、空挺戦闘ポッドのD-Dを使って人を襲わなくてはならなかった。皮肉にも、ナイトセイバーズはそのD-Dの捕獲を依頼されて……。
ニセナイトセイバーズが新型ブーマを強奪。それはラルゴがセイバーズに叩きつけた挑戦状だった。ネネやリンナが憤慨する中、シルヴィを失った悲しみから立ち直れないでいたプリスは、アンリの後をつけてゲノムタワーへと向かう。だが、そんなプリスにアンリは、シルヴィの仇だと憎しみの刃を突きたてた……。
人気ロックシンガーのヴィジョン（レイカ）がコンサートのために来日。だが、実は彼女は妹の敵討ちのために来日したのだった。そして、ブーマの開発責任者を誘拐して、会長のクインシーを誘き出すレイカ。だが、彼はアンドロイドだった。そこへ現れたナイトセイバーズは、ヴィジョンと護衛のブーマを撃退するが……。
署長である叔父に頼み、ADポリスの見学にきたリサ。その目的はナイトセイバーズの正体をスクープすること。そんなリサが、ハードスーツのバイザー越しにネネの素顔をスクープした。だがその時、ナイトセイバーズに挑戦するため、新型ブーマを従えたマッドサイエンティストのミリアムがADポリスを占拠してしまい……！
In the year 2033 A.D. The malevolent Boomer androids of the Genom Corporation are a plague upon the city of MegaTokyo, and the Knight Sabers, a shadowy band of high-tech mercenaries have their hands full fighting them.
