Numbuh 4 learns he is to be sent to a boarding school – but he is not worried, as he's always escaped from them before. However, he then learns that the school is being run by an evil kid called "Madame Margaret", a girl who is getting high-tech aid from none other than her future self. Madame Margaret's abominable plan is to create a twisted utopia where girls rule the world, using a demonic weapon called the girlifying ray that can turn anything feminine. The team does not have much chance to stop this until they receive aid from Numbuh 4's own future self. Now the team must defeat her and save the future.
La directora del internado de niñas en el cual Número 4 es encerrado, tiene unos perversos planes de hacer que el mundo sea dominado por niñas. Al no poder evitarlo, el espacio temporal se altera y el futuro es gobernado por las niñas crueles. Número 4 (ya anciano) conoce a la nieta de Kuki de ese futuro y junto con su grupo van a una nueva batalla en la que 4 regresa al pasado y le pide ayuda al sector V para frustrar el plan de la directora y borrar ese terrible futuro. NOTA: En el capitulo anterior los agentes 2, 3, 4 y 5, les borraron la memoria, pero en esta temporada ya tienen sus memoria restauradas sin explicación alguna. En Operation: Z.E.R.O. (La Pelicula), Número 86 explicó que uso el módulo recuperador(un aparato capaz de devolver la memoria a cualquier chico del barrio destituido) para devolverles sus memorias y lo mantuvo en en secreto.
