Sonia Ledesma, inspectora del Cuerpo Nacional de Policía, llega a su nuevo destino: el Grupo de Desaparecidos que lidera el veterano Santiago Abad. Sonia ha pedido ingresar en esta unidad por motivos personales: su marido desapareció hace cuatro años. En su primer día, Sonia se enfrenta a la desaparición de una joven que parece haber abandonado voluntariamente su feliz vida familiar.
Sonia y Sebas investigan la desaparición de un niño de una lujosa urbanización de las afueras. El inspector al cargo centra sus sospechas en la interna y en su novio. Mientras, Rodrigo y Azhar trabajan en la desaparición de dos adolescentes, amigas íntimas pero pertenecientes a mundos y religiones diferentes.
Rodrigo y Sebas investigan la desaparición de un representante de joyería. Sus sospechas se centran en la pareja propietaria de una joyería donde el desaparecido fue visto por última vez. Por su parte, Sonia y Azhar evitan por casualidad el robo de un bolso.
Una familia entera desaparece sin dejar rastro. Han dejado los teléfonos móviles, la mesa puesta y los platos a medio comer. Sonia y Sebas investigan el entorno, empezando por el único miembro de la familia que no ha desaparecido, una adolescente que ha manifestado repetidas veces su deseo de ver muerta a toda su familia.
En una desolada urbanización de adosados, un niño desaparece cuando está jugando en la misma puerta de su casa. Ningún testigo, ninguna pista, solo un complicado entorno familiar que el Grupo 2 deberá desentrañar.
El hijo de Santiago, experimentado butronero, sale bajo fianza, acusado de un fabuloso golpe en una joyería. Santiago se hace cargo de la fianza y de su hijo, con quien retoma una complicada y dolorosa relación. Mientras, Sonia toma el mando de la unidad y trabaja en la desaparición de un adolescente con problemas de anorexia.
Una desgraciada sucesión de errores policiales y judiciales obliga a exhumar los restos de un joven desaparecido hace más de diez años y dado por muerto hace tres. El cadáver resulta no ser el suyo. Sonia y Azhar inician una carreta contrarreloj para saber que fue del desparecido y ofrecer respuestas a su indignado padre.
Después de una discusión a cuenta del uso del móvil, una adolescente se baja del coche de su madre y desaparece en medio de un desolado polígono industrial. Una pareja celebra su aniversario en un hotel de lujo. En medio de la noche, el marido desaparece.
El bebé de Luis y Vane es sustraído de su carrito en medio del parque, en un despiste de esta. Todas las sospechas apuntan a Carmen, enzarzada en una guerra sin cuartel con Riky y los padres de la criatura. Salvo Rodrigo, el Grupo 2 sospecha también de ella, así como la prensa y buena parte del barrio.
La mujer de un mago desaparecido hace cuarenta años está convencida e que tiene nuevas pistas sobre su marido. Sonia está a punto de volar a Somalia en busca de Mikel cuando una llamada de Rodrigo da al traste con sus planes: Santiago ja desaparecido.
Todo apunta a que el cadáver carbonizado encontrado en la furgoneta corresponde de Santiago. Así lo cree Sonia cuando llega a su casa y se encuentra con que Gaspar está dentro. Gaspar le muestra las joyas que han desencadenado todo y le abre los ojos sobre quién está detrás: la Comisaria Velasco.
El Grupo 2 consigue desenmascarar a la comisaria Velasco y liberar a Santiago y a Gaspar, que se encuentra gravemente herido. Cuando Santiago vuelve al trabajo, se entera de la investigación amateur que está llevando a cabo Carmen sobre el empresario que tuvo que ver con la desaparición de su hijo. Inmediatamente pone a Sonia al frente del caso.
En un hotelucho en la frontera de Kenia y Somalia, Sonia espera noticias de Mikel. Las tendrá muy pronto, en la identificación de su cadáver. Mientras Sebas y Azhar siguen las pistas proporcionadas por la maquilladora sobre la adolescente de video porno, Santiago y Rodrigo van estrechando el cerco sobre las personas que vieron por última vez al hijo de Carmen.
La aparición de Berta, una joven en coma, reaviva la investigación de otra chica, Lidia; quién desapareció hace un año junto con ella. Sonia tendrá un encontronazo determinante para la investigación. A la unidad llega la desaparición de otra joven. Mientras, Carmen sigue en la lucha por recuperar a su hijo.
La investigación sobre el paradero de Lidia resulta cada vez más complicada y todas las vías parecen irse cerrando. Mientras tanto, un nuevo caso llega a la asociación: un anciano ha desaparecido sin dejar rastro. Al ir siguiendo su rastro, se van descubriendo comportamientos sorprendentes.
Se confirma que Lidia se encuentra en poder de los hermanos Reyes. Santiago y Sonia urden un plan para llegar hasta ella. Carmen, recibe una petición de auxilio por parte del joven culpable de la desaparición de su hijo y Azhar se infiltra en la casa de la casa de las hijas de Ulahabi.
Cuando Lidia parece estar localizada, desaparece una vez más. El clan de los Reyes ha decidido que es un peligro para la familia. A la vez, en los alrededores de un pantano aparece un coche abandonado. Los efectos personales de la mujer que iba en el siguen raramente intactos en su interior.
Tras los sucesos del pantano, en la población se empieza a especular sobre un asesino en serie. Un nuevo caso llega a la Unidad, un joven desaparece el día de su boda. Sonia, Ramallo y sus relaciones llenas de tensión, se hacen cargo del caso. Azhar, comienza a meterse en problemas.
El hallazgo de unos huesos de mujer calcinados reabre un antiguo caso de desaparición. Mientras, la investigación de las desapariciones del pantano no consigue resultados. Aumenta la tensión entre Ramallo y Sonia. Sebas, por su parte, tiene problemas de convivencia con sus hijas.
Un tercer coche abandonado en las cercanías del pantano aumenta la incertidumbre, se encuentra el cadáver de una de ellas con evidentes signos de violencia, volviendo a ganar peso la teoría de un asesino en serie. Las tensiones entre Sonia y Ramallo crean un ambiente complicado.
Nueva información reabre el caso de Breixo Ribera, estudiante desaparecido hace nueve años. La aparición de un nuevo sospechoso que podría estar tras la muerte de Dolores y la constatación de que la familia de Belén tiene las claves de su desaparición, precipitan el caso del pantano hacia su desenlace.
Nadie ha vuelto a saber de Carmen tras irse al encuentro de su hijo Pablo. Santiago se centra en su búsqueda, mientras Ramallo y Sonia, en total sintonía, se ocupan de un menor desaparecido cuyos padres serán asesinados más tarde. Azhar y Sebas ponen punto final al caso de Breixo.
El resultado de las pruebas de ADN de Carmen la sumen en la desmoralización. Sebas se preocupa por su hija Gema debido a las redes sociales. Ousman recibe noticias del paradero de su cuñado, Sonia y Ramallo se hacen cargo de la investigación. Azhar y Miguel consolidan su relación.
Haciéndose cargo Sonia de la Unidad, investigan la desaparición de Gabor Molnar, un estudiante húngaro de 18 años hijo de un ministro. La Embajada de Hungría meterá presión. Sebas empezará paralelamente la búsqueda de un menor fugado de un centro de menores. Ambos casos colisionarán.
La unidad investiga la desaparición de Emma, una joven que lleva desaparecida unos meses y cuya madre desconfía de los mensajes que la envía asegurando que está bien. Sonia se centrará en la desaparición de Víctor, el exmarido de su cuñada Maite. Carmen recibirá una tremenda sorpresa.
Carmen pretende recuperar el tiempo perdido, pero Pablo ya no es el niño que era. Azhar trabaja en la búsqueda de la madre de Loli, una de las empleadas de la limpieza de la Unidad, descubriendo una verdad dolorosa. Sebas y Ramallo resuelven el caso de un delincuente desaparecido y relacionado con la muerte de un Senador.
Un viejo detective escapado de una cínica psiquiátrica inicia un nuevo caso, trayendo a la luz otro que se quedó sin resolver años atrás. Carmen recibe una llamada de Amira, madre adoptiva de Pablo. Sonia y Ramallo participan en una competición de pádel, acercándose más. Mercedes, ex mujer de Sebas, regresa a casa.
Sonia se recupera del ataque recibido y Ramallo trata de confirmas sospechas. La Unidad aborda el caso de la desaparición de una anciana que parece haberse desvanecido en el aire y a la que buscan sus dos peculiares hijas. Pablo tiene que afrontar situaciones comprometidas que le causan una gran confusión.
La desaparición de un conocido youtuber pone de nuevo en marcha a la Unidad. Ramallo no dispuesto a resignarse decide emprender la guerra por su cuenta. Tanto él como Sonia se verán envueltos en situaciones peligrosas. El caso de Pablo provoca cada vez más tensiones entre quienes tienen que ver con él.
