Ran wakes up in a hut in the woods and discovers someone has treated the wounds from when she fell. Eventually, Kazuha finds Ran and calls Kogoro in. Heiji radios them from the next room. They all go over and find that the room is filled with pictures of Shin'ichi with knife marks in them. Heiji figures out the case, and they head back to Hinohara's house. There, Heiji reveals that Shin'ichi is actually Makoto, who used plastic surgery to look like Kudou Shin'ichi. Shirigami-sama steps into the room and is revealed to be Shin'ichi. After Makoto is arrested, Ran, Heiji, Shin'ichi, Kazuha, and Kogoro walk back toward the hotel. Before they can reach it, APTX 4869 starts to wear off, and Heiji helps Shin'ichi escape to the bathroom to change back. Haibara had been hiding there, and she gave Shin'ichi another antidote. Then, she says to return to Tokyo before he changes back if he wishes to keep his identity a secret.
Les accusations qui pèsent sur Shinichi dans le village se font de plus en plus pressantes. Ran, qui s'est perdue dans la forêt, est sauvée et soignée par une mystérieuse entité. Confronté à ses crimes, le détective de l'Est s'effondre, mais une autre personnalité encore plus attendue fait son apparition et fait la lumière sur l'affaire.
Alors qu'ils rentrent tous à Tokyo, une voiture sur l'autoroute se met à racler la barrière de sécurité. Grâce à la vivacité de réaction de Shinichi l'accident est évité. Cependant, le chauffeur est mort et les deux détectives lycéen vont devoir travailler en coopération pour trouver l'assassin.
Ran viene trovata da Kazuha nella baita mentre Heiji, nella stanza accanto, rinviene una serie di fotografie ed articoli su Shinichi. Heiji inizia a capire cosa è successo
Ran se despierta en una cabaña en el bosque y se da cuenta de que alguien le curó las heridas. Después, ella, Kogoro, Kazuha y Heiji ven una habitación con fotos de Shinichi con marcas de cuchillo en ellas. Heiji vuelve a casa de los Hinohara y desvela que el Shinichi amnésico es en realidad Makoto, que usó la cirugía estética. Entonces el Shiragami entra en la habitación y se descubre que es Shinichi. Finalmente, Makoto es arrestado y todos se dirigen al hotel. A medio camino el efecto del antídoto empieza a desaparecer, y Heiji ayuda a Shinichi a llegar al baño donde estaba Haibara, que le da otro antídoto. Más tarde, mientras vuelven, el grupo de Kogoro descubre a un hombre estrangulado en su coche y se detienen para investigar.
Ran es desperta en una cabana al bosc i s'adona que algú li va córrer les ferides. Després, ella, Kogoro, Kazuha i Heiji veuen una habitació amb fotos de Shinichi amb marques de ganivet en elles. Heiji torna a casa dels Hinohara i desvetlla que el Shinichi amnèsic és en realitat Makoto, que va utilitzar la cirurgia estètica. Llavors el Shiragami entra a l'habitació i es descobreix que és Shinichi. Finalment, Makoto és arrestat i tots es dirigeixen a l'hotel. A mig camí l'efecte de l'antídot comença a desaparèixer, i Heiji ajuda Shinichi a arribar al bany on hi havia Haibara, que li dona un altre antídot. Més tard, mentre tornen, el grup de Kogoro descobreix un home estrangulat al seu cotxe i s'aturen per investigar.
