Vor sieben Jahren kommt der Bombenentschärfer Hakibara bei einem Einsatz ums Leben. Vier Jahre später erwischt es seinen Kollegen Matsuda. Matsuda war kurz vorher in die Abteilung von Kommissarin Satou gewechselt.
The death of Satou's last partner haunts her when she is put up against the same bomber. The bomber likes to place bombs around the city. Some bombs will display the location of an even bigger bomb if left for the last three seconds, this resulted in the death of Satou's partner in the past. After following clues placed by the bomber, Takagi and Conan are trapped in an elevator, where they await the bomb's clue to the location of an even bigger bomb. Conan disarms the bomb before the last second as he has already figured out the last part of the code. He stops the bomber and he is captured.
Quelque temps après les attentats à la bombe pendant la parade de football, une autre bombe a détoné, blessant gravement l'inspecteur Shiratori au passage. Le coupable vise directement les forces de police, et semble être le même qui prit la vie de l'agent Matsuda, 3 ans plus tôt. Au péril de leurs vies, Conan et l'inspecteur Takagi mènent l'enquête.
In un flashback viene ripercorsa la vita di Matsuda da quando è diventato collega di Miwako Sato fino al momento della sua morte. Durante un'indagine relativa ad un attentatore seriale, l'agente si è sacrificato per leggere l'indizio presente su una bomba che avrebbe permesso di capire la posizione di un altro ordigno; Matsuda, nell'ultimo sms inviato a Sato, oltre a rivelarle il luogo in cui recarsi le scrive: "Mi piacevi davvero".
Un asesino de hace 7 y 3 años vuelve tras matar a Matsuda, el compañero de Sato, y ahora quiere llevarse consigo la vida de Takagi. Conan también intervendrá para salvar a Takagi y a "la persona más importante para él"
