| Name | First Aired | Runtime | Image | |
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| S04E01 | 黒の組織から来た女 大学教授殺人事件 |
January 4, 1999
YTV (JP)
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100 | |
| S04E02 | 競技場無差別脅迫事件（前編） |
January 11, 1999
YTV (JP)
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25 | |
| S04E03 | 競技場無差別脅迫事件（後編） |
January 18, 1999
YTV (JP)
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25 | |
| S04E04 | 奇術愛好家殺人事件（事件篇） |
January 25, 1999
YTV (JP)
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25 | |
| S04E05 | 奇術愛好家殺人事件（疑惑篇） |
February 1, 1999
YTV (JP)
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25 | |
| S04E06 |
奇術愛好家殺人事件（解決篇）
season finale
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February 8, 1999
YTV (JP)
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25 | |
| S04E07 | 消えた凶器捜索事件 |
February 15, 1999
YTV (JP)
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25 | |
| S04E08 | 青の古城探索事件（前編） |
February 22, 1999
YTV (JP)
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25 | |
| S04E09 | 青の古城探索事件（後編） |
March 1, 1999
YTV (JP)
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25 | |
| S04E10 | 最後の上映殺人事件（前編） |
March 8, 1999
YTV (JP)
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25 | |
| S04E11 | 最後の上映殺人事件（後編） |
March 15, 1999
YTV (JP)
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25 | |
| S04E12 | SOS！歩美からのメッセージ |
April 12, 1999
YTV (JP)
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25 | |
| S04E13 | 結婚前夜の密室事件（前編） |
April 19, 1999
YTV (JP)
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25 | |
| S04E14 | 結婚前夜の密室事件（後編） |
April 26, 1999
YTV (JP)
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25 | |
| S04E15 | 疑惑の天体観測 |
May 3, 1999
YTV (JP)
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25 | |
| S04E16 | 上野発北斗星３号（前編） |
May 10, 1999
YTV (JP)
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25 | |
| S04E17 | 上野発北斗星３号（後編） |
May 17, 1999
YTV (JP)
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25 | |
| S04E18 | 本庁の刑事恋物語（前編） |
May 24, 1999
YTV (JP)
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25 | |
| S04E19 | 本庁の刑事恋物語（後編） |
May 31, 1999
YTV (JP)
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25 | |
| S04E20 | 路面電車急停止事件 |
June 7, 1999
YTV (JP)
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25 | |
| S04E21 | 遊園地バンジー事件 |
June 21, 1999
YTV (JP)
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25 | |
| S04E22 | 自動車爆発事件の真相（前編） |
June 28, 1999
YTV (JP)
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25 | |
| S04E23 | 自動車爆発事件の真相（後編） |
July 5, 1999
YTV (JP)
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25 | |
| S04E24 | 謎の老人失踪事件 |
July 12, 1999
YTV (JP)
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25 | |
| S04E25 | 園子のアブない夏物語（前編） |
July 19, 1999
YTV (JP)
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25 | |
| S04E26 | 園子のアブない夏物語（後編） |
July 26, 1999
YTV (JP)
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25 | |
| S04E27 | 水中の鍵密室事件 |
August 2, 1999
YTV (JP)
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25 | |
| S04E28 | 本庁の刑事恋物語２（前編） |
August 9, 1999
YTV (JP)
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25 | |
| S04E29 | 本庁の刑事恋物語２（後編） |
August 16, 1999
YTV (JP)
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25 | |
| S04E30 | 沈黙の環状線 |
August 23, 1999
YTV (JP)
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25 | |
| S04E31 | 怪奇五重塔伝説（前編） |
September 6, 1999
YTV (JP)
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25 | |
| S04E32 | 怪奇五重塔伝説（後編） |
September 13, 1999
YTV (JP)
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25 | |
| S04E33 | 流水亭に流れる殺意 |
September 20, 1999
YTV (JP)
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25 | |
| S04E34 |
空飛ぶ密室 工藤新一最初の事件
season finale
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September 27, 1999
YTV (JP)
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50 | |
| S04E35 | 月と星と太陽の秘密（前編） |
October 11, 1999
YTV (JP)
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25 | |
| S04E36 | 月と星と太陽の秘密（後編） |
October 18, 1999
YTV (JP)
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25 | |
| S04E37 | 少年探偵団消失事件 |
October 25, 1999
YTV (JP)
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25 | |
| S04E38 | 鳥取クモ屋敷の怪（事件編） |
November 1, 1999
YTV (JP)
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25 | |
| S04E39 | 鳥取クモ屋敷の怪（疑惑編） |
November 8, 1999
YTV (JP)
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25 | |
| S04E40 | 鳥取クモ屋敷の怪（解決編） |
November 15, 1999
YTV (JP)
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25 | |
| S04E41 | ビーナスのキッス |
November 22, 1999
YTV (JP)
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25 | |
| S04E42 | 暗闇の中の死角（前編） |
November 29, 1999
YTV (JP)
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25 | |
| S04E43 | 暗闇の中の死角（後編） |
December 6, 1999
YTV (JP)
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25 | |
| S04E44 | よみがえる死の伝言(ﾀﾞｲｲﾝｸﾞ・ﾒｯｾｰｼﾞ)(前編) |
December 13, 1999
YTV (JP)
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25 | |
| S04E45 |
よみがえる死の伝言(ﾀﾞｲｲﾝｸﾞ・ﾒｯｾｰｼﾞ)(後編)
season finale
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December 20, 1999
YTV (JP)
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25 |
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