El 8 de Octubre de 2011 José Bretón asesinó en Córdoba a sus hijos Ruth y José y los incineró en una hoguera. En un primer momento sus restos no fueron identificados, pero gracias a la intervención de Paco Etxeberria se pudo dar un vuelco al caso y culpar a Bretón de sus crímenes. El programa reconstruye los hechos.
Sacar a la luz huesos que se encuentran bajo tierra y cerrar historias de personas desaparecidas durante la Guerra Civil es el objetivo de este programa de 'El Lector de Huesos'. El antropólogo forense Paco Etxeberria y el periodista Dani Álvarez se adentrarán en el interior de las simas de Gaztelu y de Otsaportilo, ambas en Navarra, para identificar los restos óseos que allí se encuentren.
El 22 de septiembre de 2013 el cuerpo de Asunta Basterra, de 12 años, fue encontrado en una pista forestal de un municipio de La Coruña. Su padre, Alfonso Basterra, y su madre, Rosario Porto, fueron condenados por el asesinato. Aunque el caso está cerrado, para la justicia la muerte y posterior autopsia de la niña siguen presentado muchos interrogantes.
Dani Álvarez se adentra en el caso que más ha marcado a Paco Etxeberria, tanto personal como profesionalmente: los asesinatos de José Antonio Lasa y José Ignacio Zabala, primeras víctimas mortales de los GAL. Su investigación forense fue clave para la detención y encarcelamiento de los asesinos y de quienes supervisaron este crimen, el gobernador civil de Gipuzkoa.
El periodista Dani Álvarez y el antropólogo forense Paco Etxeberria se adentrarán en un escalofriante caso de estafa y asesinato, el de la joven de 17 años Marta Couceiro, cuyo cadáver fue hallado en la casa de veraneo de sus padres en Gorliz. Su novio, David Villafañe, fue declarado culpable del crimen. El móvil: cobrar unos seguros de vida que Marta había firmado semanas antes.
Paco Etxeberria recreará el accidente aéreo Yak-42, que se estrelló en Turquía en 2003 y en el que murieron 62 militares españoles. Con la colaboración de la Unidad de Policía Científica de la Ertzaintza explicará cómo se deben identificar los restos de las víctimas. ADN, huellas dactilares, carta dental... son algunas de las técnicas de identificación que Paco explicará sobre el terreno.
Miriam, Toñi y Desirée, las niñas de Alcàsser, Valencia, fueron secuestradas, torturadas, asesinadas y enterradas en una fosa en 1992. El 13 de setiembre salieron de sus casas para ir a la discoteca Coolor haciendo autostop. Nunca llegaron a la discoteca. Sus cuerpos aparecieron en febrero de 1993 en el paraje de La Romana. Paco Etxeberria y Dani Álvarez abordan el trágico suceso en un capítulo que estará marcado por el hallazgo casual de un diente humano, posiblemente de una de las niñas.
Paco Etxebarria y Dani Álvarez recuerdan el trágico atentado de Hipercor y analizarán las consecuencias en el ser humano de las explosiones provocadas por el atentado con coche bomba de ETA en el centro comercial Hipercor de Barcelona, con 21 muertos y 45 herido, el 19 de junio de 1987.
Juan Carlos Aguilar, falso Shaolin y fundador del monasterio "Océano de la Tranquilidad", asesinó a dos mujeres y descuartizó a una de ellas en su gimnasio "Zen 4" de Bilbao el 02 de junio de 2013. El periodista Dani Álvarez y el antropólogo forense Paco Etxeberria siguen las huellas del criminal para desentrañar su motivación y modus operandi.
El caso Salvador Allende: ¿suicidio o asesinato de un presidente? Reconstrucción de la muerte de Salvador Allende, presidente de Chile, el 11 de septiembre de 1973. La autopsia dictaminó que se trató de un suicidio. El periodista Dani Álvarez acompañará al antropólogo forense Paco Etxeberria en uno de los casos que más le han marcado profesionalmente.