Akira has returned alive after defeating Beta, but soon Tokyo is targeted by a large-scale hacking attack. He dives into the network along with Ygg's clones to figure out the cause, and fights the enemies within, but in the meantime the hacking spreads to the entire world. It takes over military bases and fires a volley of ICBMs, seeking to destroy the entire world. In order to save humanity, Akira makes a decision born of love.
Le monde est en danger ! Corrompues par la malveillances de Bêta, les IA contrôlant des armes du monde entier menacent de détruire le monde. Akira est le dernier espoir de l'humanité et il plonge dans le réseau pour sauver ce qui peut l'être.
Beta ist besiegt, doch schnell wird klar, dass die Bedrohung noch nicht ausgestanden ist. Denn auf einmal wird Tokyo erneut angegriffen. Die Mitglieder der Anti-Ex-Arm-Einheit fliehen gemeinsam mit dem CEO von Schwerindustrie Iriya in den Keller des Firmensitzes. Akira entscheidet sich, gegen diesen zunächst unbekannten Feind erneut in die Schlacht zu ziehen, doch er scheint seine Grenzen endgültig erreicht zu haben.