ある病院で入院患者が幽霊になった。 この原因究明を託されたのが会社員の水木。 調べていくと“幽霊族最後の生き残り”と称する夫婦に行き着いた。 しかもその幽霊族は死に瀕しながらも妊娠しているという。 会社に真相を報告するべきか？ そっとしておいてほしいと懇願する幽霊族を守るべきか？ 迷っていると「病院にいた幽霊が死んだ」との連絡が入った。 果たして幽霊族とは？ 水木が目にしたのは、死んだ母親の墓場から這い出してきた赤ん坊（鬼太郎）の姿だった。 この世に怪異が誕生し、常軌を逸した恐怖に水木は……!!