連続殺人事件が起きた聖恋島の荒天がおさまり、参加者全員があす帰れることになったと剣持警部(沢村一樹)から知らされる一(道枝駿佑)。その矢先、医師仲間を二人失っていた影尾教授(佃典彦)が行方不明になる。捜索に出た一達は、舟着小屋の明かりに気づいて駆けつけるが、開いてるはずのドアには鍵が。仕方なく反対側のドアに回りこみ、窓から中を覗くと誰かが中で倒れていた。すると、突然小屋の明かりが消え、今度は小屋から逃げていく光が！「あれは犯人か？」何者かに翻弄されるように光を追いかけたその先で、影尾教授の遺体が発見された。この時、一は、島にいる者がその場に揃っていることに気づく。これまでも事件発生時のアリバイが全員にあったことを不自然に感じるが、佐木(岩﨑大昇)が撮影した現場の映像に何かを発見して...。そんな中、凪田(吉谷彩子)が、殺された医師達についてのある事実を告白する。一方、眠らずに推理に没頭する一の事が心配の美雪(上白石萌歌)は、自分なりのアシストをしようと考えて...。哀しい哭き声が響く孤島での連続殺人事件。真犯人の正体がついに明かされる...!
發生連續殺人事件的聖戀島因惡劣的天氣好轉，劍持警部（澤村一樹飾）告訴一（道枝駿佑飾）所有參加者明天就能回家。他才剛這麼說完，已經失去兩位醫生同伴的影尾教授（佃典彥飾）就失蹤了。出外找他的一等人發現停船小屋的燈光而匆忙趕過去，但本來沒上鎖的門卻被鎖上。一行人無計可施，只好繞到另一頭的門，從窗戶窺看屋內後發現有人倒在裡面。停船小屋的燈光此時突然消失，他們看到有一道光正從小屋逃離！一行人心想那也許就是犯人，就像是被某人玩弄於掌心般，他們追著那道光，最終發現影尾教授的屍體。一在這時察覺在島上的人全都在現場。到目前為止，每當事件發生，每個人都有不在場證明，這讓一覺得不自然。他在看了佐木（岩崎大昇飾）拍攝的現場影片後驚覺某件事。與此同時，芷田（吉谷彩子飾）說出和被殺害的醫生們有關的某件事情真相。另一方面，美雪（上白石萌歌飾）因為擔心不眠不休地埋頭推理的一，開始思考該如何協助他。在哀傷的哭聲迴響的孤島上發生的連續殺人事件，真凶的真面目即將被揭開！
With the news of clear weather in the morning, Kindaichi can finally leave the island where sirens' cries echo. But that night, Dr. Kageo mysteriously goes missing. Kindaichi and the others search for him on the island and find a boathouse with a locked front door. From the window of the back door, they see a man collapsed on the floor. Just then, the lights turn off in the cabin and a floating light exits. As if guided by someone, the party follow the light to find Dr. Kageo's corpse. However, at that moment, everyone on the island was gathered at the scene. Kindaichi perceives that every person was present during all three murders and he discovers a video that Saki recorded. The group is in shock when Nagita reveals an unsettling secret concerning Dr. Kageo. Meanwhile, Miyuki is worried sick about Kindaichi and has not been able to sleep. She tries to help him in her own way. Who is the killer among them?
