Filho de Dom João IV, rei de Portugal e de Luísa de Gusmão, rainha de Portugal, nasceu em Lisboa a 21de Agosto de 1643 e morreu em Sintra a 12 de Setembro 1683, e está sepultado em Lisboa, no Mosteiro dos Jerônimo e casou com Dona Maria Francisca Isabel de Sabóia, e não teve descendentes. Começou a governar em 1656 e terminou em 1668 Dom Afonso VI sofreu em criança de uma grave doença desconhecida na época e que o deixou para sempre muito diminuído física e intelectualmente. O governo do reino não lhe estava reservado, porque não era o filho mais velho. Porém, a morte prematura de seu irmão Dom Teodósio, trouxe a seus pais, para além do desgosto, um grave problema para resolver. É que Dom Afonso VI não tinha capacidades para governar o país. Esta situação tão delicada ainda se agravou mais com a morte de Dom João IV, três anos depois de Dom Teodósio. A rainha, Dona Luísa de Gusmão, assumiu então a Regência do reino, visto que Dom Afonso VI tinha apenas treze anos e continuava a revelar uma total incapacidade para governar. A rainha defrontava-se então com a arrastada Guerra da Restauração que continuava a consumir vidas e dinheiro. O rei, alheado do que se passava no país, rodeava-se de gente pouco recomendável da qual se destacava um italiano de nome Conti, que exerceu durante muito tempo uma grande influência sobre o monarca. Dom Afonso VI casou em 1666 com Dona Maria Francisca. Porém, este casamento não veio resolver problema nenhum, porque segundo parece, o rei não poderia assegurar descendência.
