Lupin, Goemon, and Jigen take a mini-helicopter and head to the mysterious “Drifting Island” looking for a treasure rumored to be hidden somewhere on it. Through their exploration of the island, the trio encounters the lethal “Nanomachine,” the island’s security system. The trio triggers the alarm, springing “the Nanomachine” to life. The key to solving the island’s mystery lies in the small nation of Zufu. This once prosperous nation is now ruled by the ruthless, knife-collecting, General Headhunter. Fujiko does her usual probing and hacks into General Headhunter’s computer hoping to find some crucial information. Zenigata has received a video message from Lupin in which Lupin announces his desire for the priceless treasure. Oleander, a fiery blond officer with some hidden secrets of her own, steps in to help Zenigata. Armed with their newly found information, Lupin, Goemon, Jigen, and Fujiko go back to “Drifting Island,” but this time they are followed by General Headhunter.
Dopo aver salvato alcuni uomini rinchiusi in una prigione, il cui direttore aveva il sadico passatempo di dare la caccia ai detenuti cui permetteva di tentare la fuga, Lupin si reca in un piccolo Paese del Sud Est asiatico, Zufu, per mettere le mani sul tesoro dell'ultima famiglia reale, da poco spodestata da un colpo di Stato guidato dallo spietato e sinistro generale Cacciateste. Il tesoro in questione però si trova su di un'isola resa inespugnabile da un sofisticato sistema cibernetico che uccide all'istante chiunque tenti di avvicinarsi alla cassaforte.
L'unica persona in grado di rendere inoffensivo il sistema di sicurezza sarebbe il principe Pannish, che però risulta ufficialmente morto durante il golpe
L'Île dérivante, la nouvelle île au trésor visée par Lupin et sa bande, abriterait le trésor national du royaume du Zufu, aujourd'hui sous la coupe du régime dictatorial du général Kubikari. Ce dernier tient le pays d'une main de fer et cherche à mettre la sienne sur le trésor de l'Île dérivante. Une rumeur faisant état que la fille du défunt roi serait la clé pour parvenir jusqu'au trésor, Kubikari la garde recluse jusqu'à ce qu'elle vienne à accepter de collaborer avec lui. Lupin tente alors d'enlever la princesse, mais son plan échoue : la princesse a échangé son rôle avec une agente secrète répondant au joli nom d'Oleander (Ole pour les intimes). Une stratégie remarquable mise au point par le redoutable inspecteur Zenigata, qui vient de débarquer au Zufu…
ズフ共和国では、前国王と王子が将軍に粛清されて以来、首狩り将軍による独裁政治が続いていた。だが、政権をとってなお、前国王が隠したとされる漂流島の財宝を入手できていなかった。お宝を狙うルパンは防衛システムの秘密を握るとされる将軍の娘・エメラに接触。だがそれはオーリエンダーという囮の女だった。彼女は将軍に殺されたはずの王子が生きていると知って動揺する。そして、将軍からルパンに100万ドルの賞金がかけられ、殺し屋たちがルパンに襲いかかる。
2014년까지는 루팡 3세의 마지막 극장판이었으나, LUPIN the Third 지겐 다이스케의 묘비가 이 극장판의 뒤를 이어 20년 만에 극장개봉하게 되었다. 루팡의 자켓은 붉은색.
