Die Mädchen sind alle jetzt die 3-A-Klasse, als ein neues Ereignis seine Schatten voraus wirft. Der legendäre Star Crystal wurde in der magischen Fakultät in England gestohlen. Zwei Botschafter aus England, die die Gestalt von zwei Zeichnungen annehmen, teilen dies Ereignis Negi mit und erklären, dass sie auch zu seiner Überwachung gekommen seien. Als Nodoka auch hinter Negis Geheimnis kommt, droht diesem die Verwandlung in ein Tier. Nur weil Nodoka seine zweite Partnerin mit einem vorläufigen Vertrag wird, kann er dieses Schicksal abwenden. Als die drei plötzlich in eine Magische Welt gezogen werden und auch noch Evangeline in dieser Welt erscheint und von der fremden Kraft angegriffen wird, muss auch Nodoka zeigen, was sie drauf hat.
Negi helps Takahata investigate some mysterious phonomena in the form of dark clusters on campus. Asuna hosts the inaugural meeting of the Chupacabra Research Group as she and the girls search for the evasive creature. Meanwhile, two spirits from the Magic Academy arrive with some news about a missing Star Crystal, but they also plan to watch that Negi doesn't use magic in front of the girls!
お姉ちゃん、お手紙は届きましたか？ ３年生になって新学期も始まり、忙しくて楽しい毎日をすごしています。そんな中、魔法学園からシチミさんとモツさんという特使がやってきて、伝説のマジックアイテム『スタークリスタル』が盗まれたことを教えてくれました。その影響が麻帆良学園に出ているみたいで、なんだか嫌な雰囲気です。と、思っていたら、今度はのどかさんに魔法を見られてしまって仮契約まで交わすことに！
Negi ayuda a Takahata a investigar algunos fenómenos misteriosos en forma de grupos oscuros en el campus. Asuna organiza la reunión inaugural del Grupo de Investigación Chupacabra mientras ella y las chicas buscan a la criatura evasiva. Mientras tanto, dos espíritus de la Academia de Magia llegan con algunas noticias sobre la falta de un Star Crystal, ¡pero también planean ver que Negi no usa magia frente a las chicas!
