天才ハッカーによる囚人の脱獄事件が勃発。だが、犯人・鏑木徹（ユースケ・サンタマリア）は焼死体として発見された。殺人の容疑者として逮捕されたのは、警視庁科学特捜班ＳＴのリーダー・赤城左門だった。罪を認めた赤城は、その理由を「鏑木は許しがたいことをした」と言う。許しがたいこととはいったい何なのか？その真意がわからないまま、リーダー不在でSTは解散することに……。だが、赤城は拘置所から脱走。警察は追跡に青山・結城・黒崎・山吹、つまりSTメンバーを召集。皮肉にも、STは赤城を捕まえるため特別復活することに。 最高のチームが最大の敵になった瞬間だった。赤城vsSTの逃走劇が始まる。<br /> 異動を２日後に控えたＳＴの責任者・百合根友久も、赤城の無実を信じ、捜査に参加、事件の鍵を探り当てる。それは、「フギン」という感染したコンピューターから情報を抜き取るサイバー暴露ウイルスだった。事情を知る謎の女・堂島菜緒美（安達祐実）に行き着くが、ひと足早く何者かによって誘拐されてしまう。取り残された菜緒美の娘・椿（鈴木梨央）と行動を共にする百合根。そこへ赤城が現れて……。張り巡らされた警察の包囲網の中、事件を追うことになったバディ。百合根は赤城の真実を知ることができるのか？そして、複雑に絡み合う難事件の謎は、すべて解けてしまうのか……!?