Craig Sonntag, der die Sprengung der Big Horn überlebt hat, plant, mit seinem infizierten Blut das Gemüse im Garten seiner Mutter zu verunreinigen, um das lebensgefährliche Signal auch über Lebensmittel zu verbreiten. Doch Molly und Cavennaugh können ihn rechtzeitig aufhalten. Das Problem aber ist, dass sich auf den unzähligen Wrackteilen des Frachters mit hoher Geschwindigkeit Kristalle bilden, die das Signal der Aliens weitertragen.
Molly and Cavennaugh discover some strange happenings in a missing Big Horn crew member's hometown when they investigate the disappearance of a Threshold field agent.
Un des deux agents, qui surveillaient, dans l'Indiana, la maison de la mère de l'un des membres disparus du Big Horn, a disparu ! Cavennaugh et Molly se rendent sur place pour savoir ce qu'il se passe... Dans le même temps, l'équipe de Threshold, ne pouvant pas empêcher les fragments du bateau atteindre les côtes, décide d'aller à la source pour découvrir ce dont il est question...
Goodman ügynök eltűnik, miközben Molly és Cavennaugh megpróbálják megtalálni a Küszöb akcióban is résztvevő embert. Egy helyi templomban a pap éppen az üvegerdőről prédikál, Molly pedig megdöbbenve tapasztalja, hogy több hívő ember is álmodott már hasonlókat. Arthur és Lucas ezalatt arra törekednek, hogy megtalálják a Big Horn hajótestet a tengerfenéken.
Caffrey e Cavennaugh si recano a New Harmony per indagare sulla scomparsa di un agente che era stato posto di guardia alla casa di Craig Sontag, un membro dell'equipaggio della Big Horn. Giunti sul posto, scoprono che un sacerdote del luogo ha iniziato un nuovo culto ispirandosi ai suoi sogni, nei quali continua a vedere il mare di vetro profetizzato nel libro dell'Apocalisse. Molly scopre inoltre un orto nel quale sono stati coltivati organismi geneticamente modificati mediante gli stessi cristalli prodotti dalla sonda aliena. Nel frattempo, Pegg e Ramsey tentano di recuperare il relitto della Big Horn ma scoprono che all'interno e nei pressi della nave si sono sviluppati gli stessi cristalli del sogno ricorrente di Lucas, i quali hanno modificato sia la fauna marina che la conformazione del fondale. I due ricercatori individuano anche il sottomarino coreano che era stato mandato ad intercettare la Big Horn poco dopo il loro intervento. A New Harmony, Molly viene presa in ostaggio da Sontag. Scopre che l'uomo è responsabile della scomparsa dell'agente e delle coltivazioni, che ha modificato utilizzando il suo sangue. Sean riesce ad intervenire in tempo ed a salvare la dottoressa.
Molly y Cavennaugh descubren que ocurren sucesos extraños en la ciudad natal de uno de los agentes de Threshold misteriosamente desaparecido.
