| Name | First Aired | Runtime | Image | |
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| S04E01 | 忍びよる脅威！「謎の来訪者」 |
October 17, 2007
TV Tokyo
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| S04E02 | さらばデュエルアカデミア！十代の選ぶ道 |
October 24, 2007
TV Tokyo
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| S04E03 | ダークネスの真相！十代ＶＳ吹雪 |
October 31, 2007
TV Tokyo
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| S04E04 | 融合する魂！ネオスＶＳ Ｆ・Ｇ・Ｄ（ファイブ・ゴッド・ドラゴン） |
November 7, 2007
TV Tokyo
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| S04E05 | シャル・ウイ・デュエル？ペアデュエルへの招待 |
November 14, 2007
TV Tokyo
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| S04E06 | 十代ＶＳ明日香！ 秘めた想いの伏せカード |
November 21, 2007
TV Tokyo
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| S04E07 | サイコ・ショッカーからの挑戦状 |
November 28, 2007
TV Tokyo
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| S04E08 | 受け継がれしサイバー・ダーク・ドラゴン |
December 5, 2007
TV Tokyo
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| S04E09 | 目指せ万丈目!プロデュエリストへの道！ |
December 12, 2007
TV Tokyo
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| S04E10 | アームド・ドラゴンＶＳドラグーン・Ｄ・エンド |
December 19, 2007
TV Tokyo
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| S04E11 | 恩返しデュエル！クロノスＶＳ元祖ドロップアウト・ボーイ |
December 26, 2007
TV Tokyo
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| S04E12 | 卒業デュエル開始！ネオスＶＳホルスの黒炎竜 |
January 4, 2008
TV Tokyo
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| S04E13 | 決断の代償！オブライエン炎の闇 |
January 9, 2008
TV Tokyo
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| S04E14 | 斎王再び！「絶対運命決定力」発動！！ |
January 16, 2008
TV Tokyo
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| S04E15 | 運命の終焉！マグマ・ネオスＶＳザ・ダーク・ルーラー |
January 23, 2008
TV Tokyo
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| S04E16 | デュエルアカデミアの危機！立ちはだかる宝玉獣 |
January 30, 2008
TV Tokyo
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| S04E17 | ダークネスの侵攻！奪われた記憶 |
February 6, 2008
TV Tokyo
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| S04E18 | 発動！「クリアー・ワールド」恐怖のネガティブエフェクト |
February 13, 2008
TV Tokyo
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| S04E19 | バトルロワイヤル！十代ＶＳヨハンＶＳ藤原 |
February 20, 2008
TV Tokyo
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| S04E20 | 絆を守りしものレインボー･ネオスＶＳクリアー・ヴィシャス・ナイト |
February 27, 2008
TV Tokyo
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| S04E21 | 恐怖のコンボ！「虚無と無限」 |
March 5, 2008
TV Tokyo
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| S04E22 | 最後の希望！遊城十代 |
March 12, 2008
TV Tokyo
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| S04E23 | さよなら十代！涙の卒業式 |
March 19, 2008
TV Tokyo
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| S04E24 |
真の卒業デュエル！十代ＶＳ伝説のデュエリスト
series finale
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March 26, 2008
TV Tokyo
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