„Das System Tönnies“ ist der Auftakt der „ZDFzoom“-Doku-Staffel „Die Spur“. Die Autoren erhalten exklusive Einblicke rund um Deutschlands größten Schlachtbetrieb. Die Reporter begegnen mehreren Whistleblowern aus dem Inneren und dem Umfeld des Tönnies-Konzerns. Durch ihre weitreichenden Recherchen entsteht ein in Teilen dubioses Bild im Zusammenhang mit dem wirtschaftlich erfolgreichsten Fleischproduzenten Deutschlands. Die 45-minütige Spurensuche der „ZDFzoom“-Reporter Hannes Vogel und Tobias Zwior führt nach Bulgarien, Zypern und an die deutsch-niederländische Grenze. Die Reporter stoßen wiederholt auf mutmaßliche Unregelmäßigkeiten im Umfeld des Tönnies-Konzerns.