近未来、理沙とローナは、高校生だけどエクスドライバーとして活躍中。AIカーが暴走してしまったら無事故で止めるのが2人の仕事。ある夜、いかれた男達の乗る違法改造されたAIカーが現れた。愛車のインプレッサで追いかける理沙。だが、ふとした油断で理沙の乗るインプレッサが大破してっっ!!
理沙とローナの窮地に現れた少年、走一。彼は理沙より年下の上、飛び級で同級生になってしまうほどの頭脳の持ち主だった。走一のエクスドライバーとしてチームに加入する事が面白くない理沙は、テストコースで走一に挑むが、あっさりと負けてしまう。そんな時、理沙たちの学校のテスト問題を積んだAIカーが暴走した!!
ある日、eX-D本部に届いたテレビ局からの密着取材の申請をうけて、理沙やローナたちのところに取材クルーがやってくることになった。しかも、番組レポーターが人気レポーターのケイン時岡と知って、心ウキウキ大ハリキリの理沙。相変わらず無関心なローナだったが、そのローナが取材のメインに抜擢されてしまい……。
AIカーが道路の両端に並び、その間を暴走AIカーが突っ走っていた。それを追う理沙、ローナ、走一。だが理沙の油断が原因で、ストラトスは出遅れてしまう。そこへ1台のバイクが駆け付け、鮮やかな手並みで暴走を食い止めた。そのバイクの乗り手こそ、バイクのエクスドライバー、エクスライダーであった！
エクスドライバーとAIカー企業の努力の甲斐あって、暴走事故も減って久々に休暇をもらった理沙とローナ。二人はロータスヨーロッパで海に向かうが、その途中渋滞が発生した。それは暴走車が原因だったが、いつもと違うのは、そのAIカーは無人！ その上、謎のプログラムが仕掛けられた改造車だったのだ！
AIカーの暴走を仕組みエクスドライバーに挑戦してきたのは、かつて宗方の部下でもあった藤堂とその仲間たちだった。彼らの挑発に乗った理沙は重傷を負ってしまう。さらに、ローナのヨーロッパは大破。走一でさえも彼らの暴走を止められなかった。理沙たちの出動が無理な今、藤堂の宣戦布告に宗方は――!?
