In 1945, Dr. Ryuichiro Koga designed Metalder as a top-secret weapon for the Japanese Imperial Army for use in the Pacific War, modeling it after his late son, Second Sub-lieutenant Tatsuo Koga. However, the pacifistic Dr. Koga put Metalder to sleep in the Silver Carcass base and left for America to work for NASA. During the 42 years, Dr. Koga's former colleague Major Muraki became the evil God Neros, ruler of Neros Empire. God Neros sends out his massive armies to kill Dr. Koga, who learned of their organization and returned to Japan to activate Metalder. Koga desperately tries to activate his android creation, who he named Ryusei Tsurugi, but the android is unable to understand what to do. In order to give Ryusei a "purpose", Koga runs out of the Silver Carcass base, allowing Neros' troops to kill him. Suddenly seeing his creator die, Ryusei becomes shocked, and soon is beaten by Neros' troops. Ryusei becomes fueled with rage, evoking the conversion to his 'true' form, the android known as Metalder. After a brief battle with Coolgin (which he loses), Ryusei goes onward, meeting future friend Mai Ogi.
Le vieux professeur Koga ne s'est jamais remis de la mort de son fils durant la guerre du Pacifique. Suite à ce drame , il a voué son existence à la création d'un cyborg surpuissant pour protéger la paix dans le monde, auquel il a donné les traits de son défunt enfant. Pendant ce temps, la compagnie Tsutsuhara, en fait une couverture pour le diabolique Empire NEROS, déclenche de par le monde des guerres et autres catastrophes afin d'asseoir son emprise sur les marchés boursiers. Koga ayant eu vent de ce fait, décide de lancer son cyborg contre l'empire du mal. Le bon professeur sera tué par les troupes de NEROS, mais parviendra à activer Metalder avant de rendre l'âme.
Livré à lui même et sans aucune connaissance du monde qui l'entoure, Metalder devra se battre contre NEROS et tenter de faire la part entre bien et mal. Il sera aidé par Springer un chien parlant, cyborg également, qui se chargera de réparer Metalder après ses combats et de la maintenance de la base (Koga n'avait pas chômé durant toutes ces années !), ainsi que par Anna (Mai Ougi en VO), une photographe ravissante mais potiche, qui lui enseignera diverses choses de la vie courante.
Em meio à 2ª Guerra Mundial, o especialista em robótica Doutor Koga desenvolveu o andróide Metalder como arma secreta do exército japonês para ser usado na Guerra do Pacífico contra os Estados Unidos. Como modelo o Doutor Koga utilizou o seu finado filho, Tatsuo Koga, segundo subtenente da Marinha Imperial. Porém o projeto foi abandonado. Em 1987, Koga descobre a existência do Império Neroz e pouco antes de morrer, ativa Metalder.
第二次世界大戦後、アメリカに渡っていたロボット工学の世界的権威、古賀竜一郎博士が42年ぶりに日本に帰ってきた。彼が帰国したのは、世界の影でうごめく死の商人「ネロス帝国」の存在に気付き、戦死した自分の息子の竜夫をモチーフにした人造人間「超人機」を甦らせるためである。 古賀博士の帰国を知ったネロス帝国の帝王ゴッドネロスは博士を抹殺すべく、配下の四大軍団に出撃を命令した。四大軍団の攻撃により、古賀博士は負傷するが何とか秘密基地シルバーカークスにたどり着き、そこで眠っていたアンドロイドである超人機・剣流星を目覚めさせる。 しかし、博士はシルバーカークスを守り、何も知らない流星に敵の存在と人の死を教えるために自らネロスの凶刃に倒れる。それを見た流星は怒りの叫びを上げ、全エネルギーを開放。超人機メタルダーに瞬転する。しかしメタルダーはその能力を把握できないまま、ヨロイ軍団長クールギンの刃に敗れる。傷つきながらも再び立ち上がるメタルダーは自らの存在を不可思議に思い、叫ぶ。 「風よ、雲よ、太陽よ、心あらば教えてくれ！ なぜ、この世に生まれたのだ！」と。 こうしてメタルダーとネロス帝国との壮絶な戦いが始まった。
