“13”を名乗る犯人から、「日本を再生不能にした戦犯を処刑する」というメッセージが、全国各地の“被害者”宅に一斉に届けられる事案が発生。13が言う“戦犯”とは、いずれも故人のことで、“処刑”は遺骨を叩き潰すこと。被害者は遺骨を盗まれた遺族だった。遺骨の盗難は、去年から断続的に起こっていたが、警視庁は事件の全容が不明瞭であるという理由から隠蔽。その理由には、元官房室長・小野田公顕（岸部一徳）の遺骨が含まれていることも起因していた。一連の経緯をふまえ、右京（水谷豊）は小野田と因縁深い米沢（六角精児）に協力を要請。さらに、尊（及川光博）が突然、特命係にやってくる事態に。いっぽう、私塾「ながとろ河童塾」塾長の葛葉宰三（渡辺いっけい）は、被害者遺族の真野正義（柴崎楓雅）ら塾生たちと、ある行動を起こしていた。 犯人の目的も、正体も分からず、手掛かりがまったく掴めないまま、連鎖する新たな事件。そして、予測不能の罠…。小野田の“遺骨盗難”という前代未聞の事態の先に待ち受けていたのは、あまりにも意外過ぎる真実だった!! “13”という数字にこだわる犯人の狙いは!? 尊と米沢がそれぞれの立場から事件にかかわる中、 右京と薫が前代未聞の難ミッションに挑む！