Völlig fertig wird Lelouch nach der Schlacht um Tokyo an Bord des Flagschiffs Ikaruga gebracht. Die Detonation von F.L.E.I.J.A. hat zahllose Opfer gefordert - auch Nunnally wird vermisst. Diesen Moment von Zeros Unpässlichkeit nutzt Schneizel aus, um die Führungsriege der Schwarzen Ritter von der wahren Identität ihres Anführers in Kenntnis zu setzen. So erfahren Diethard, Ohgi, Tohdoh und Co. nicht nur von Lelouchs Vergangenheit als britannischer Prinz, sondern auch von dessen Geass...
A ceasefire is called so Schneizel can meet with the leaders of the Black Knights, but Lelouch is too devastated to attend. Schenizel reveals the truth about Lelouch and his Geass, as well as the many people he has used it on; a recording from Lelouch's meeting with Suzaku solidifies the evidence. In exchange for Japan's independence, the Black Knights agree to betray Lelouch. Unable to escape, Lelouch tells Kallen he was using her all along to keep her from sharing his fate, but whispers that she should live on within earshot. Lelouch is prepared to accept death, until Rolo, piloting the Shinkirō, rescues Lelouch and escapes the combined forces of the Black Knights and the Britannians. However, the excessive use of his Geass required to do so overtaxes his heart and dies after flying Lelouch to safety. Lelouch resolves to not waste the life given to him by Rolo, declaring he will kill the Emperor by his own hand.
L'arme ultime créée par Nina a ravagée la moitié de Tokyo, faisant des millions de morts. Pris d'une soudaine folie, Zero invective ses troupes, leur ordonnant de chercher Nunnally ; mais Todo les fait battre en retraite.
Sur le vaisseau amiral débarque bientôt Schneizel, venu en émissaire diplomatique libérer Cornelia. Et devant un auditoire restreint, il révèle aux Chevaliers Noirs la véritable identité de Zero, et la nature de son pouvoir, le Geass...
Zero, ancora profondamente turbato da quanto successo, si ritira nelle sue stanze, e vedendo un ciondolo che aveva regalato a Nunnally nelle mani di Rolo, Lelouch gli urla addosso tutto il suo odio affermando di aver finto di essere gentile con lui e di averlo cercato di uccidere più volte, sconvolgendo il finto fratellino. Essendo Zero non reperibile, sono i membri più importanti dell'Ordine, tra cui Tōdō e Diethard, a trattare con il primo ministro britanno, il quale sconvolge tutti rivelando loro l'identità di Zero, e fornendo prove che dimostrano come lui abbia sfruttato i giapponesi per i suoi scopi (ad esempio la registrazione di una conversazione tra Lelouch e Suzaku in cui il britanno afferma di aver costretto Euphemia a massacrare i giapponesi), prove confermate da Cornelia, Ōgi e Villetta. I Cavalieri Neri si rendono conto che loro per Zero non erano altro che pedine, e decidono di consegnarlo a Schneizel. Ōgi tuttavia dice che accetterà tale scambio solo se l’Impero cederà il controllo sul Giappone. Kallen, all'oscuro della cosa, viene mandata a chiamare Zero, e insieme si dirigono in uno degli Hangar della nave, dove i Cavalieri Neri lo prendono in trappola. Kallen è pronta a morire difendendo Lelouch, ma egli capisce che non ha via d'uscita e perciò dice che per lui la ragazza, come tutti i Cavalieri Neri, non era altro che una pedina e ammette davanti a tutti che tutte le accuse sono fondate. Kallen, sentendosi ingannata, si allontana da lui, e mentre i Cavalieri Neri stanno per giustiziarlo Lelouch le sussurra che lei deve continuare a vivere. I Cavalieri sparano ma all'improvviso sopraggiunge lo Shinkirou proteggendolo: è Rolo il pilota, che prende con sé Lelouch e lo porta in salvo usando il suo Geass. Lelouch gli dice di fermarsi perché ormai non ha più motivo di vivere, essendo Nullaly morta, e inoltre gli dice che se continuerà ad usare il Geass in quel modo il suo cuore non reggerà lo sforzo, ma Rolo non si ferma e continua ad
トウキョウ租界の決戦は多くの犠牲者を出してしまった。その混乱を突くかの如く、そのイカルガにブリタニアの特使が訪れた。自ら敵艦に乗り込んできたその人物こそ!? 最凶の楔が黒の騎士団に向けられた!?
Tirando partido da ausência de Lelouch, que se encontra em péssimas condições físicas e psicológicas, Schneizel encontra-se com os líderes dos Cavaleiros Negros.
Schneizel revela la verdadera identidad de Zero ante la Orden de los Caballeros Negros, además de su relación con el geass. Considerado traidor y devastado por la pérdida de Nunally, Lelouch está dispuesto a morir a manos de sus antiguos camaradas, pero Rolo hará hasta lo imposible por evitarlo.
修奈傑爾親自前往黑色騎士團說明了zero就是魯路修以及geass和黑色騎士團的事，魯路修在在斑鳩內被扇要、藤堂等騎士團的殘黨所包圍，同是帝國剩餘圓桌騎士亦出現在魯路修面前，危難之時羅洛現身使用了眾多次GEASS幫助魯路修逃生最終身亡。
