Sous la direction du professeur Shadoko, les Shadoks continuent de pomper pour regonfler le cosmos, et éviter ainsi le Big Blank ou la fin du monde. Face à l'immensité du ballon cosmique, la vieille cosmopompe a été améliorée. Désormais, toutes les activités des Shadoks, dès leur naissance, sont dédiées au pompage. Des clapiers ont été aménagés, où les travailleurs Shadoks peuvent pomper tout en vacant à leurs activités habituelles : chambres à pompe, cuisine à pompe, usine à pompe, bureau à pompe et chef à pompe.