The last of the terrorists are secured, and Vivio is back to her normal self. Chrono's fleet prepares to destroy the Yurikago. Unfortunately for Nanoha and Hayate, Yurikago goes into self-destruct mode, while locking them in with anti-magic fields and heavy blast doors. Meanwhile, Fate finishes off her work in Scaglietti's lab, just as the whole place starts to cave in. It's a race against time for the Forwards to rescue their mentors. How will it all end?
ロストロギア「レリック」をきっかけに始まり、管理局地上本部とミッドの地上世界を揺るがした事件は終わりを告げた。軌道拘置所に送られたスカリエッティとNo.1・3・4・7の４人。海上隔離施設に保護されることとなった残りのナンバーズとルーテシア、アギト。
数ヶ月の時を置いて機動六課の隊舎も復旧し、機動六課は日常を取り戻していった。
そうして戻ってきた日常は、同時に別れが近いことも意味していた。
軌道六課の試験運用期間は１年間。事件が解説した今、機動六課は予定通りに解散することとなる。
そして「卒業」の日。
別れと巣立ちの時を前にして、フォワードたちと隊長たちは集合し「機動六課で最後の思い出」の一時を過ごす…。
Subaru e Teana vanno verso la Saint’s Cradle per salvare i loro compagni. Caro ed Erio vanno a salvare Fate. La missione della Sesta Divisione Mobile è stata portata a termine e in seguito ci si riferirà a questo incidente come "JS".
