龍馬（福山雅治）、勝（武田鉄矢）ら勝塾の面々は、近藤長次郎（大泉洋）と大和屋の娘・徳（酒井若菜）の婚礼を祝う。そして、いよいよ神戸海軍操練所が完成する。待ちに待った操練所で操船術や砲術について学ぶ龍馬たち。しかし、そのなかで、ひとり望月亀弥太（音尾琢真）は思い悩んでいた。かつての勤王党の仲間たちが土佐藩に捕らえられ、攘夷を叫んだ長州藩が朝廷から追われ、時代は亀弥太が思い描く方には向かっていなかった。 同じ頃、薩摩藩と会津藩らによって京を追われた長州の久坂玄瑞（やべきょうすけ）たちは、帝を攘夷派の手に奪い返そうと企んでいた。過激な攘夷派は土佐でも弾圧され、後藤象二郎（青木崇高）による武市半平太（大森南朋）への尋問は厳しさを増していた。時代の流れからひとり外れた岩崎弥太郎（香川照之）は、妻の喜勢（マイコ）との間に長女が誕生し、幸せをかみしめていた。 操練所では、紀州脱藩浪士の陸奥陽之助（平岡祐太）が憎まれ口を叩きながら秀才ぶりを発揮していた。龍馬は望月亀弥太の姿が見えないことに気づく。亀弥太は京の池田屋で長州藩の志士たちと会い、帝を奪う計画を立てていた。龍馬は亀弥太を探して京に向かう。