Als die 13-jährige Binny mit ihren Eltern in eine alte Villa in Berlin-Pankow umzieht, muss sie auf einmal feststellen, dass sie ihr Zimmer mit einem 14 Jahre alten Geisterjungen teilt. Um Melchior, ihren unerwünschten Mitbewohner loszuwerden, gibt es eine Lösung: sie muss ihm helfen, kleine Verbrechen und andere Ungerechtigkeiten aufzuklären, damit er vom Geisterdasein und sie somit von ihm befreit wird. So wird die WG wider Willen zum geistreichen Ermittlerduo, das jede Menge Fälle löst und dabei mehr Spaß hat, als sie vor einander zugeben würden.
Binnys erster Schultag steht an und der Quälgeist Melchior macht die Sache nicht unbedingt leichter. Melchior folgt ihr nämlich bis in die Schule. Binny versucht sich dort trotz seiner Anwesenheit auf den Chemieunterricht zu konzentrieren. Doch dann passiert es: Sie löst aus Versehen eine Verpuffung aus und das Schulgebäude muss evakuiert werden. Währenddessen wird die Spendentruhe aus der Aula gestohlen. Binny und Melchior müssen so schnell wie möglich herausfinden, wer der Dieb ist!
Um mehr über Melchiors Vergangenheit zu erfahren, suchen Binny und Melchior einen lebenden Verwandten von Melchior: seinen Großcousin Albert, der in einer Altersresidenz lebt. Dort angekommen stellt Binny fest, dass Melchior nicht der einzige Geist ist und Binny und Melchior erfahren mehr über die geheimnisvolle Kraft von Melchiors Taschenuhr. Und dann ist da noch diese seltsame Geisterbeschwörerin, die offensichtlich nicht gutes im Schilde führt.
Binny und Melchior finden auf dem Dachboden eine Uhrenschatulle, in deren Boden ein Schlüssel angebracht ist: könnte es sein, dass sie mit dem Schlüssel mehr über Melchiors Vergangenheit herausfinden? Kurz darauf treffen sie auf Oskar, einen kleinen Geisterjungen, der auf der Suche nach seinem Hund Caspar ist. Caspar scheint verschwunden zu sein und schon bald finden Binny und Melchior heraus, dass er nicht der einzige Hund ist, der in der Gegend vermisst wird.
Binny besucht zusammen mit ihrer Freundin Luca das Fußballspiel der Schulmannschaft, bei dem auch Lucas Cousin Jonas mitspielt. Doch dann traut Binny ihren Augen nicht: Sie sieht, wie ein anderer Fußballspieler, in Jonas schlüpft. Das kann nur ein Geist sein, denn Luca hat von der Aktion nichts mitbekommen. Nach dem Spiel tritt der Geist im Fußballtrikot einfach aus Jonas heraus und verschwindet. Binny und Melchior beschließen, der Sache auf den Grund zu gehen und verfolgen den seltsamen Geist.
Mark, Binny’s Schulfreund, hat ein neues Mofa und gleich einen kleinen Unfall. Mark selbst passiert nichts, aber das Mofa scheint ziemlich lädiert zu sein und das Auto, in das Mark gefahren ist, hat eine dicke Beule. Dann stellt sich auch noch heraus, dass Marks Mofa einen Totalschaden hat und, dass die Reparatur des anderen Autos weitaus teurer als gedacht ist. Nun wird Binny misstrauisch und geht mit Melchior zu der Werkstatt: dort machen sie eine interessante Entdeckung.
Binnys Klasse macht einen Schulausflug ins Museum. Zudem ist es auch der erste Arbeitstag von Binny’s Mutter Wanda als Museums-Restauratorin. Plötzlich wird der Sicherheitsalarm ausgelöst: Die wertvollen Zaren-Juwelen sind verschwunden sowie drei Gemälde und Wanda war leider die Letzte die in dem Raum war. Sofort wird Wanda vom Museumsdirektor suspendiert, bis der Fall gelöst ist. Binny und Melchior nehmen die Ermittlungen auf und machen dabei gleich mehrere aufregende Entdeckungen. Und auch der zwielichtige Hubertus ist Melchior und Binny dicht auf den Fersen.
Melchior und Binny sind auf der Trabrennbahn. Dort hoffen sie einen versteckten Hinweis von Melchiors Eltern zu finden. Leider hat sich das Gelände in den letzten 100 Jahren ganz schön verändert und Melchior ist etwas überfordert mit der Suche. Also heuert Binny als Stallmädchen an. Schon bald lernt sie den netten Niklas kennen, der auch auf dem Gestüt arbeitet und alles scheint toll zu laufen.
Als Binny an der Schule ankommt starren alle Schüler in ihr Handy und sehen sich ein offenbar lustiges Video an. Ein mysteriöser Big X hat ein Video geschickt, auf dem der Schüler Matze nicht so gut wegkommt. Kurze Zeit später erhält auch Luca von Big X ein peinliches Foto von ihr. Der unbekannte Big X verlangt Geld, wenn sie nicht möchte, dass er das Foto an alle anderen Schüler verschickt. Gemeinsam mit Melchior beschließt Binny, sich des Falls anzunehmen und herauszufinden, wer hinter diesen gemeinen Aktionen steckt.
Binny und Melchior sind auf dem Weg zur ehemaligen Sommerresidenz der Familie von und zu Panke, denn dort hofft Melchior den nächsten Hinweis seiner Eltern zu finden, der ihn zu der versteckten Uhr führen soll. Plötzlich macht Binny eine schaurige Entdeckung, gleich hinter der Sonnenuhr liegen alte Industriefässer in einer Grube mit trüber Flüssigkeit. Ein Umweltskandal. Auch die Frau vom Umweltamt ist ratlos, man müsste die Umweltsünder auf frischer Tat ertappen. Gelingt es Binny und Melchior, den Tätern das Handwerk zu legen?
Binny und Melchior wollen ins Rosenschloss, dort hoffen sie den nächsten Hinweis von Melchiors Eltern zu finden. Währenddessen organisiert Luca den alljährlichen Schulball. Doch dann wird in der Turnhalle die Sprinkleranlage ausgelöst und Binny macht sich auf die Suche nach dem Auslöser. Schließlich finden Binny und Melchior den letzten Hinweis der Eltern, am Abend des Schulballs hoffen sie auch die Uhr zu finden, doch sie sind nicht allein.
Luca, die Binny, Hubertus und Bodo im Garten des Rosenschlosses gesehen hat, will von Binny wissen, was da eigentlich während des Schulballs passiert ist. Binny und Melchior müssen sich entscheiden, ob sie Luca ihr großes Geheimnis anvertrauen sollen. Kurze Zeit später kommen Binny und Melchior einem ungeklärten Juwelenraub auf die Spur und nehmen den Fall erneut auf … aber auch Hubertus und Bodo verfolgen einen Plan.
Binny hat Geburtstag. Während Ihre Eltern eine Überraschung vorbereiten, soll sie mit Luca ins Kino gehen. Binny bekommt von Luca eine Adresse getextet. Es ist die Straße vor dem Friedhof. Doch wo ist Luca? Da bekommt Binny einen Videoanruf von Hubertus. Er teilt Binny und Melchior mit, dass er Luca nur gegen die Übergabe der zwei Uhren freilasse. Aus Sorge um Luca, geben Binny und Melchior nach und übergeben die Uhren. Melchior, den Binny jetzt nicht mehr sehen kann, will nicht aufgeben, er beschließt, sich die Uhren zurückzuholen und begibt sich dabei in größte Gefahr.
Das schöne alte Haus, in dem der Kindergarten „Villa Sonnenschein“ untergebracht war, soll zwangsversteigert werden. Dabei gab es ein Testament, in dem eindeutig festgelegt war, dass der Kindergarten das Haus erbt. Behauptet zumindest der Geist, den Binny und Melchior im Garten des Hauses treffen. Können die beiden Detektive das Testament rechtzeitig finden, bevor das Haus versteigert und abgerissen wird?
Binny kann es kaum erwarten, zur Schule zu kommen: Heute beginnt die „digitale Woche“ – die Schüler dürfen Tablets für den Unterricht testen. Selbst der wenig schulbegeisterte Melchior ist neidisch. Doch als Direktor Rötig die Tablets ausgeben will, ist der Safe, in dem sie über Nacht eingeschlossen waren auf einmal leer. Und der einzige, der die Kombination des Safes kannte – Direktor Rötig, soll schuld sein. Können Binny und Melchior den wahren Dieb und die Tablets finden?
Ein Pinguin auf Wanderschaft, ein schwarzer Froschmann, der über Zoo-Mauern klettert und jede Menge rätselhafte Einbrüche – irgendwas ist mächtig faul im Berliner Zoo. Können Binny und Melchior herausfinden, wer sich nachts in den Tiergehegen herumtreibt? Und warum überhaupt? Denn offensichtlich wurde nichts gestohlen.
Binny und Luca drehen mit Melchiors tatkräftiger Unterstützung einen Film für die Schule. Da verschwindet auf einmal ihre Filmausrüstung. Ist ein konkurrierendes Filmteam dafür verantwortlich? Oder sind die drei Freunde, ohne es bemerkt zu haben, in eine ganz andere Sache verwickelt?
Binny und Luca verbringen mit ihren Freunden Niklas und Mark einen schönen Tag auf dem Minigolfplatz. Doch plötzlich wird Niklas beschuldigt, mit Falschgeld bezahlt zu haben. Binny will Niklas Unschuld beweisen und zusammen machen sich die Freunde auf die Suche nach dem fiesen Fälscher!
Mark ist einem betrügerischen Internet-Handel auf den Leim gegangen: statt eines neuen Smartphones, hat er seine gesamten Ersparnisse in ein Stück Seife investiert. Auch Binnys und Melchiors Versuch, Marks Geld über die Post zurück zu beschaffen, scheitert. Doch dann hat Binny eine einfache aber geniale Idee...
Auf der Suche nach Uhren-Hüter-Wappen, treffen Binny und Melchior auf die verschrobene Burgherrin Elvira von Hammerfels. Die glaubt, mit dem Geist ihres Urahns in der Burg zu kommunizieren. Als Binny und Melchior in der großen Bibliothek einen Teil einer Schatzkarte finden, ist Elvira Feuer und Flamme. Doch dann gibt es einen Einbruch in der Burg. Ist etwa noch jemand hinter dem Schatz her? Und gibt es wirklich ein Burggespenst?
Lucas Mutter Steffi wird beim Verlassen eines Kaufhauses als Ladendiebin erwischt. Binny, Melchior und Luca glauben an die Unschuld der Polizei-Kommissarin und wollen in einer nächtlichen Aktion den wahren Übeltäter überführen.
Auf der Suche nach der ‚Feuer-Uhr‘, entdecken Binny und Melchior ein 300 Jahre altes Geistermädchen, das in der Uhren-Schatulle eingesperrt war. Wie sie dort hineingeraten ist und wer sie überhaupt ist, weiß sie nicht – sie kann sich an nichts erinnern. Können Binny und Melchior ihr helfen und das 300 Jahre alte Geheimnis aufklären?
Binny und Melchior haben endlich die wahre Identität von Rhett Thorn entdeckt und müssen sich jetzt mit einem ehemaligen Gegner verbünden um Rhetts Vorhaben zu verhindern. Doch dann macht Rhett Melchior ein schicksalhaftes Angebot...
